结论：项目质疑被撤诉后是否需要回复，取决于撤诉的具体原因、撤诉后的法律状态以及您的实际需求。以下从不同角度进行分析：
一、撤诉原因及法律状态
原告主动撤诉：
- 若原告因证据不足、和解或其他原因主动向法院申请撤诉，并得到法院的准许，那么案件将终结，不再继续审理。
- 在此情况下，您作为被告，若未收到法院的进一步通知或要求，通常无需主动回复。但如果您认为有必要，可以主动与原告或法院沟通，了解撤诉的具体原因和后续安排。
法院裁定撤诉：
- 若因原告未按时缴纳诉讼费、未按时出庭等违反诉讼程序的行为，法院裁定按撤诉处理，那么案件同样终结。
- 在此情况下，您同样无需主动回复，但应关注法院是否会发出相关的裁定书或通知书，并妥善保管以备后续需要。
二、您的实际需求
维护自身权益：
- 如果您认为撤诉可能涉及您的合法权益，如原告撤诉后可能再次起诉或采取其他法律行动，您可以考虑主动回复或采取相应措施。
- 例如，您可以向法院申请出具撤诉裁定书，以证明案件已终结，并作为后续可能法律纠纷的证据。
澄清事实或消除误解：
- 如果撤诉涉及对您的不实指控或误解，您可能希望通过回复来澄清事实，维护个人或企业的声誉。
- 在此情况下，您可以考虑通过正式渠道（如律师函、公开声明等）进行回复，但需确保回复内容真实、准确，并避免引发新的法律纠纷。
促进和解或协商：
- 如果撤诉是双方和解或协商的结果，您可能需要根据和解协议或协商内容来决定是否需要回复。
- 例如，如果和解协议中规定了双方需就撤诉事宜进行确认或回复，那么您应按照协议要求执行。
三、法律建议
- 咨询专业律师（此处虽为常规建议，但为保持回答完整性而保留，实际回答中可侧重于具体法律行动建议）：在处理此类问题时，建议您咨询专业律师以获取更具体的法律建议。不过，既然您已向我咨询，我会尽力提供全面的法律分析。
- 保留相关证据：无论是否需要回复，您都应妥善保管与案件相关的所有证据和文件，以备后续需要。
- 关注后续动态：即使案件已撤诉，您也应关注原告是否可能再次起诉或采取其他法律行动，以便及时应对。
总结：项目质疑被撤诉后是否需要回复，需根据撤诉原因、法律状态及您的实际需求来决定。在处理此类问题时，建议您保持谨慎态度，并考虑咨询专业律师以获取更具体的法律建议。如果您有任何进一步的法律问题或需要进一步的法律分析，请直接向我咨询。