结论：水上客运公司法人代表、总经理是否可以开船，需分情况讨论，具体如下：

1. 若其具备相应船员资质且符合公司规定及法律法规要求，则可以开船
   根据《中华人民共和国船员条例》等相关规定，驾驶船舶需持有相应类别的船员适任证书。若法人代表或总经理已通过专业培训、考试，取得与拟驾驶船舶类型、吨位、航区相匹配的适任证书（如内河船舶船员适任证书、海船船员适任证书等），且公司章程、内部管理制度未禁止其兼任船员职务，同时其驾驶行为不违反《安全生产法》中关于“主要负责人不得擅自离岗从事与安全生产无关工作”的强制性规定（若其同时为公司安全生产主要负责人），则其可以依法驾驶船舶。

2. 若其未取得船员资质，或资质与船舶类型不匹配，或违反公司规定及法律法规，则不可以开船

   • 资质缺失或不符：未取得船员适任证书，或证书等级、类别、航区与拟驾驶船舶不符的，属于无证驾驶或超范围驾驶，违反《船员条例》第五十五条，可能面临警告、罚款（对个人处2000元以上2万元以下罚款，对单位处3万元以上15万元以下罚款），甚至吊销证书的处罚。
     
   • 违反公司规定：若公司章程、内部管理制度明确禁止法人代表或总经理兼任船员职务（例如为规避管理责任、确保管理层专注决策等），则其开船行为可能违反公司治理规则，需承担内部纪律责任。
     
   • 违反安全生产规定：若法人代表或总经理同时为公司安全生产主要负责人（根据《安全生产法》第五条，生产经营单位的主要负责人是本单位安全生产第一责任人），擅自离岗驾驶船舶可能导致安全生产管理缺位，违反《安全生产法》第二十一条关于主要负责人职责的规定，可能面临行政处罚（如停产整顿、罚款）或刑事责任（若引发重大事故）。

建议：

• 若法人代表或总经理希望驾驶船舶，应先通过正规培训考取相应船员资质，并确保资质与船舶类型匹配；
  
• 查阅公司章程及内部管理制度，确认是否允许管理层兼任船员职务；
  
• 若同时担任安全生产主要负责人，需评估驾驶行为是否影响安全生产管理职责履行，必要时应委托其他合格人员代为管理。
  

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