核心结论：调解款已打入法院账户后又申请执行的，需分情况处理，具体如下：
若申请执行的是调解款本身：
- 情况分析：调解款打入法院账户，通常意味着该款项处于法院的监管之下，等待按照调解协议或法院裁定的方式进行分配或支付。若此时又申请执行，可能是出于对调解款支付进度、方式或金额的异议。
- 处理方式：首先，应确认申请执行的具体内容，若是要求加速支付或变更支付方式，可与法院沟通，说明情况，请求法院协调处理。若是认为调解款金额有误或存在其他争议，则需通过法律程序（如提出异议、申请再审等）来解决。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民事诉讼法》及相关司法解释，当事人对调解协议的内容有异议的，可以在调解协议生效后一定期限内提出异议或申请再审。
若申请执行的是调解协议中未涵盖的其他债务：
- 情况分析：调解协议可能仅解决了部分争议，若当事人之间还存在其他未解决的债务或纠纷，一方可能基于其他债权债务关系再次申请执行。
- 处理方式：此时，法院将按照新的执行申请，对新的债务进行审查。若该债务确实存在且未得到履行，法院将依法进行执行。但需注意，若调解协议中已明确约定了双方之间的所有债权债务关系均已了结，则再次申请执行可能面临被驳回的风险。
- 法律依据：根据《中华人民共和国民事诉讼法》关于执行程序的规定，法院执行的是生效法律文书所确定的义务。若新的执行申请所依据的法律文书与调解协议无冲突或调解协议未涵盖该债务，则法院将依法执行。
若存在误解或误操作导致重复申请执行：
- 情况分析：在实际操作中，也可能存在因误解、误操作或信息沟通不畅等原因导致的重复申请执行情况。
- 处理方式：一旦发现重复申请执行，应及时与法院沟通，说明情况，请求法院撤销或合并执行申请。同时，也应与对方当事人进行沟通，避免不必要的法律纠纷和诉讼成本。
- 建议：为避免此类情况的发生，当事人在申请执行前应仔细核对调解协议内容、执行申请书等法律文书，确保申请执行的准确性和必要性。
总结与建议：调解款打入法院账户后又申请执行的情况需根据具体原因和法律事实来处理。建议当事人在遇到此类情况时，首先与法院和对方当事人进行沟通，明确申请执行的具体内容和原因，然后根据实际情况选择合适的法律途径来解决争议。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可直接向我咨询。