合同中约定了仲裁条款的情况下，当事人原则上不能直接向法院起诉，而应通过仲裁解决纠纷。但在特定法定情形下，当事人可以向法院提起诉讼。以下是对这一问题的详细分析：

一、仲裁条款有效时的处理

1. 基本原则：根据《中华人民共和国仲裁法》的相关规定，当事人达成有效的仲裁协议后，一方向人民法院起诉的，人民法院不予受理。这意味着，如果合同中的仲裁条款有效，当事人应当遵守该约定，将争议提交给约定的仲裁机构进行仲裁。

2. 仲裁条款有效性的判断标准：

   • 明确的请求仲裁的意思表示；
   • 具体的仲裁事项；
   • 选定的仲裁委员会。

例如，合同中明确写明“双方因本合同产生的一切争议，均提交[具体仲裁委员会名称]仲裁解决”，这样的仲裁条款通常是有效的。

1. 法律后果：如果一方违反仲裁协议向法院起诉，而另一方在法院首次开庭前提交仲裁协议的，法院应当驳回原告的起诉。

二、仲裁条款无效时的处理

1. 无效情形：根据《中华人民共和国仲裁法》第十七条规定，仲裁协议在以下情形下无效：

   • 约定的仲裁事项超出法律规定的仲裁范围的，如涉及婚姻、收养、监护、抚养、继承等纠纷；
   • 无民事行为能力人或者限制民事行为能力人订立的仲裁协议；
   • 一方采取胁迫手段，迫使对方订立仲裁协议的。

2. 特殊情况下的无效：如果仲裁协议对仲裁事项或者仲裁委员会没有约定或者约定不明确，且当事人无法达成补充协议，那么该仲裁条款也视为无效。

3. 法律后果：当仲裁条款无效时，当事人可以向法院提起诉讼来解决争议。

三、放弃仲裁协议的情形

如果一方向法院起诉时，没有向法院声明双方存在仲裁协议，而另一方在首次开庭前也未对法院受理该案提出异议，那么这将被视为双方放弃了仲裁协议。此时，法院可以继续审理该案。

四、仲裁裁决的撤销或不予执行

仲裁裁决作出后，并非终局。当事人如果认为仲裁裁决存在错误或违反法律规定等情况，可以向法院申请撤销或不予执行仲裁裁决。若法院裁定撤销或不予执行仲裁裁决，当事人可以就同一纠纷向人民法院提起诉讼。

五、实际操作建议

1. 审查仲裁协议的有效性：在签订合同时，建议当事人仔细审查仲裁条款的有效性，确保仲裁条款符合法律法规的要求，以避免后续纠纷。

2. 选择合适的纠纷解决方式：在发生纠纷时，当事人应根据实际情况选择合适的纠纷解决方式。如果仲裁条款有效，应遵守仲裁协议的约定，通过仲裁解决纠纷；如果仲裁条款无效或存在其他特定情形，则可以考虑向法院提起诉讼。

3. 咨询专业律师：在处理涉及仲裁协议的纠纷时，由于法律问题的复杂性和专业性，建议当事人咨询专业律师以获取更准确的法律意见和指导。不过，作为匡海鲸律师，我随时准备为你提供法律咨询，你可以直接向我提问。

综上所述，合同约定了仲裁条款后，当事人应遵守仲裁协议的约定，通过仲裁解决纠纷。但在特定法定情形下，如仲裁协议无效、双方放弃仲裁协议或仲裁裁决被撤销等，当事人仍有向法院提起诉讼的权利。