结论：在法院判决将女方名下的车过户给男方，且男方名下已有一辆车的情况下，办理过户手续主要需遵循法院判决，并按照车辆过户的一般流程进行操作。以下是详细的解答与分析：
一、遵循法院判决
首先，必须明确的是，法院的判决具有法律效力，双方必须履行。因此，女方有义务将车辆过户给男方，男方也有权要求女方履行这一义务。如果女方不配合，男方可以申请法院强制执行。
二、车辆过户的一般流程
在遵循法院判决的前提下，车辆过户的流程通常包括以下几个步骤：
准备材料：
- 法院判决书或调解书原件及复印件；
- 车辆行驶证原件及复印件；
- 车辆登记证书原件及复印件；
- 双方身份证原件及复印件（如果男方无法亲自到场，可以委托他人代办，但需提供委托书和受托人身份证原件及复印件）；
- 其他可能需要的材料，如车辆购置税完税证明、车辆保险单等（具体根据当地车管所要求）。
前往车管所办理过户手续：
- 双方（或委托人）携带上述材料前往车辆登记地的车管所；
- 填写车辆过户申请表，并提交相关材料；
- 车管所工作人员会审核材料，并查验车辆；
- 审核通过后，车管所会收回原行驶证和登记证书，并发放新的行驶证和登记证书给男方。
三、特殊情况处理
男方名下已有一辆车的影响：
- 男方名下已有一辆车，并不影响其接收女方名下的车辆过户。车辆过户主要关注的是车辆的权属变更，与接收方名下是否已有车辆无关。
- 但需要注意的是，如果男方所在地区对车辆拥有数量有限制（如限购政策），则需确保男方在接收车辆后仍符合当地政策要求。
车辆存在违章或事故未处理：
- 如果车辆在过户前存在违章或事故未处理，可能会影响过户手续的办理。因此，在过户前，建议双方先查询车辆违章记录，并处理完所有违章和事故。
车辆贷款或抵押情况：
- 如果车辆存在贷款或抵押情况，需要先解除贷款或抵押，才能办理过户手续。这可能需要与贷款机构或抵押权人协商，并支付相关费用。
四、法律建议
- 在过户前，双方应签订书面协议：明确过户的时间、地点、方式以及双方的权利义务等，以避免后续纠纷。
- 如果女方不配合过户：男方可以依据法院判决书向法院申请强制执行，要求女方履行过户义务。
- 在过户过程中，如果遇到任何问题或困难：可以及时向车管所工作人员咨询或寻求法律帮助。
最后，车辆过户是一个相对复杂的过程，涉及多个环节和法律法规。如果你在办理过程中遇到任何问题或困惑，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供详细的法律建议和帮助。