当您在医疗期内发现公司注销了，这确实是一个比较棘手的情况，但您仍然有权利维护自己的合法权益。以下是我为您详细梳理的应对步骤和建议：

一、明确法律规定与自身权益

首先，您需要了解的是，根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者在医疗期内，用人单位是不得解除劳动合同的。即使公司面临注销等特殊情况，这一规定依然适用。如果公司未经合法程序在医疗期内解除了与您的劳动合同，那么这一行为是违法的，您有权要求相应的赔偿。

二、全面收集证据

为了维护自己的权益，您需要全面收集相关证据，包括但不限于：

• 劳动合同：证明您与公司之间的劳动关系。
• 工资条、工作证等：进一步佐证您的劳动关系及在公司的工作情况。
• 医院诊断证明、病假申请及批复：证明您确实处于医疗期内，且已经按照公司规定申请了病假。
• 公司注销的相关公告或文件：了解公司注销的具体情况，包括注销时间、原因等。
• 其他可能证明公司违法解除劳动合同的证据：如辞退通知、聊天记录、邮件等。

三、了解公司注销后的责任承担

公司注销并不意味着其法律责任的消失。根据相关法律法规，公司注销后，其债权债务应由清算组进行清算，并按照法定程序进行分配。如果公司注销前未依法与您解除劳动合同或未支付您应得的赔偿，那么清算组有责任在清算过程中处理这些问题。

四、与公司清算组或相关责任方协商

在收集了足够证据后，您可以尝试与公司清算组或相关责任方进行协商，指出公司注销前在医疗期内违法解除劳动合同的行为，并要求恢复劳动关系（如果可能）或支付相应的赔偿金。赔偿金应包括您在医疗期内的工资、医疗费用以及按照经济补偿标准二倍的赔偿金等。

五、向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁

如果协商无果，您可以向当地劳动监察部门投诉，请求他们责令公司清算组或相关责任方改正违法行为。同时，您也可以向劳动争议仲裁委员会提交书面仲裁申请，主张您的合法权益。在仲裁过程中，您需要提交全部证据材料，并详细陈述您的诉求和理由。

六、关注自身疾病治疗与费用报销

在维权的同时，您也需要关注自身的疾病治疗情况。及时使用基本医疗保险报销医疗费用，减轻经济负担。如果医疗费用较高或基本医疗保险无法完全覆盖，您可以考虑向民政部门申请医疗救助或寻求慈善机构的帮助。

七、寻求法律援助或委托律师代理

如果您在维权过程中遇到困难或不确定如何操作，可以寻求法律援助或委托律师代理。律师可以为您提供专业的法律建议和指导，帮助您更好地维护自己的合法权益。

综上所述，虽然公司在医疗期内注销给您带来了困扰，但您仍然有权利通过合法途径维护自己的权益。希望以上建议能对您有所帮助。