关于您提出的“合同是个人名义签的可以开公司发票吗”这一问题，这确实是一个涉及合同签订主体、交易实质以及税务法规要求的复杂问题。以下是我为您提供的详细分析：
一、合同签订主体与发票开具的关系
个人代表公司签订合同：
- 如果个人是公司的法定代表人，或者持有公司明确授权的代理证书，并在合同中明确注明了这一点，那么该个人签字的合同实际上代表的是公司行为。
- 在这种情况下，交易实质是公司之间的业务往来，因此可以由公司开具发票。
个人名义签订合同：
- 若个人以个人名义签订合同，且没有证据表明其代表公司行事，那么这份合同就是个人与个人（或个人与另一实体）之间的合同。
- 在这种情况下，除非有特殊情况（如业务实际归属公司，且能提供足够证据），否则不能以公司的名义开具发票。
二、交易实质与发票开具的合规性
业务属于个人：
- 如果合同所涉业务是个人行为，与公司无关，那么个人不能要求公司开具发票。
- 发票开具要求“三流一致”，即货物、劳务及应税服务流、资金流、发票流必须一致。若业务属于个人，则无法满足这一要求。
业务实际归属公司：
- 在某些特殊情况下，尽管合同是由个人签订的，但业务最终是为公司开展的，公司实际提供了商品或服务并承担纳税义务。
- 在这种情况下，如果符合相关规定并具备合理商业理由，可以由公司开具发票。但通常需要提供足够的证据来证明业务的实际归属，如内部协议、沟通记录、款项流向等。
三、税务法规的遵循
- 发票的开具必须真实、合法、有效，并与实际的交易行为相符。
- 任何试图通过虚构交易或滥用发票开具权限的行为都是不合规的，并可能面临法律制裁。
总结与建议：
合同个人签字能否开公司发票，主要取决于合同业务的实际主体以及该业务与公司之间是否存在真实、合法的关联关系。在实际操作中，建议您在签订合同前明确交易主体和发票开具的相关事宜，并确保所有行为都符合税务法规和相关规定的要求。如果您对此仍有疑问或需要更具体的法律意见和税务指导，我建议您咨询专业律师或税务顾问。