针对您提出的“居住权协议未登记怎么处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，要明确的是，居住权合同与居住权的设立是两个不同的概念。根据《中华人民共和国民法典》第三百六十八条的规定，设立居住权的，应当向登记机构申请居住权登记，居住权自登记时设立。这意味着，仅仅签订居住权合同，并不意味着居住权就已经设立。
对于您的情况，如果您与对方已经签订了居住权合同，但尚未办理登记手续，那么：
居住权合同本身仍然有效：尽管居住权未登记，但双方签订的居住权合同本身仍然具有法律效力。合同权利人可以基于这份合同向对方主张权利，比如要求对方履行合同中的某些义务。
居住权未设立：由于未办理登记手续，根据法律规定，居住权并未设立。这意味着，合同权利人不能直接以居住权人的身份对抗合同之外的第三人，也不能直接享有居住权所带来的各项权益。
建议尽快办理登记：为了最大程度地保障自身的居住权益，我建议您在签订居住权合同后，尽快与对方一起到不动产登记中心办理登记手续。只有完成了登记，居住权才能真正设立，您才能享有法律所赋予的居住权权益。
注意合同条款的明确性：在签订居住权合同时，双方应当明确约定当事人的姓名或名称和住所、住宅的位置、居住的条件和要求、居住权期限等关键条款。这些条款将直接影响到居住权的设立和行使，因此务必确保它们的明确性和准确性。
综上所述，虽然居住权合同未登记不影响合同本身的法律效力，但会影响居住权的设立。为了保障您的居住权益，我建议您尽快与对方办理居住权登记手续。同时，在签订合同时也要注意条款的明确性，以避免后续可能出现的纠纷。