控股股东通过关联交易损害公司利益时，其他股东一般不可以直接提起违约之诉，但可以提起股东代表诉讼或根据具体情况考虑其他法律途径。以下是对此问题的详细分析：
一、违约之诉的适用性
违约之诉通常基于合同关系产生，要求一方因违反合同约定而承担法律责任。在控股股东通过关联交易损害公司利益的情况下，其他股东与控股股东之间并不直接存在合同关系，因此，其他股东一般不能直接以控股股东违反合同约定为由提起违约之诉。
二、股东代表诉讼的适用性
法律依据：
- 根据《公司法》的相关规定，当公司的董事、监事、高级管理人员或控股股东等主体损害公司利益时，符合条件的股东有权为了公司的利益以自己的名义直接向人民法院提起诉讼，即股东代表诉讼。
适用条件：
- 股东需满足一定的持股比例或持股时间要求（具体根据《公司法》及公司章程的规定）。
- 股东需先向公司提出书面请求，要求公司提起诉讼，但公司拒绝或未在合理期限内提起诉讼的，股东方可自行提起。
- 股东提起诉讼时，应以自己的名义，但诉讼利益归属于公司。
诉讼效果：
- 如果股东代表诉讼成功，控股股东需向公司承担赔偿责任，从而间接保护了其他股东的利益。
三、其他法律途径
直接诉讼：
- 在某些特定情况下，如果控股股东的行为同时损害了其他股东的直接利益（如侵犯股东权益、违反股东协议等），其他股东可能可以直接提起诉讼，要求控股股东承担赔偿责任。但这种情况较为特殊，需具体分析。
公司内部治理机制：
- 其他股东可以通过公司内部治理机制，如提议召开股东会、修改公司章程、选举或罢免董事等，来制约控股股东的行为，保护公司利益。
行政监管与刑事追究：
- 如果控股股东的行为涉嫌违反行政法规或刑事法律，其他股东可以向相关监管机构举报或向公安机关报案，要求追究控股股东的行政责任或刑事责任。
四、建议与总结
- 对于其他股东而言：在发现控股股东通过关联交易损害公司利益时，应首先评估自身是否符合提起股东代表诉讼的条件，并考虑通过公司内部治理机制或行政监管途径来解决问题。
- 在提起诉讼前：建议其他股东收集充分证据，包括关联交易的具体情况、控股股东的过错程度、公司受损情况等，以便在诉讼中充分证明自己的主张。
- 如有需要：其他股东可以咨询专业律师，以获取更具体的法律建议和指导。
综上所述，控股股东通过关联交易损害公司利益时，其他股东一般不能直接提起违约之诉，但可以通过股东代表诉讼或其他法律途径来维护公司利益和自身权益。如有具体法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。