若公司不同意变更登记事项且存在应变更而未变更的法定情形，市场监管局可依据《公司法》《市场主体登记管理条例》等规定，视情节轻重给予行政处罚，具体处罚措施及分析如下：

1. 责令限期改正
   根据《市场主体登记管理条例》第四十六条，若公司未依法办理变更登记（如名称、住所、法定代表人、注册资本、经营范围等事项变更后未登记），市场监管局可首先责令公司限期（通常15-30日）补办变更登记。此阶段以教育整改为主，若公司按期完成，通常不会进一步处罚。

2. 罚款处罚
   若公司逾期未改正，市场监管局可依据《市场主体登记管理条例》第四十六条，对公司处1万元以上10万元以下罚款；情节严重的（如多次违法、拒不改正或造成严重后果），可吊销营业执照。

   • 关键点：罚款幅度与违法情节挂钩，例如未变更事项涉及重大经营风险（如未登记经营范围变更导致超范围经营），可能被认定为“情节严重”。
     

3. 其他关联处罚

   • 超范围经营处罚：若公司未变更经营范围但实际从事需许可的经营活动，市场监管局可依据《市场主体登记管理条例》第四十三条，没收违法所得，并处1万元以上10万元以下罚款；情节严重的，吊销营业执照。
     
   • 虚假登记处罚：若公司通过提交虚假材料变更登记（如伪造股东签字），市场监管局可依据《市场主体登记管理条例》第四十四条，撤销变更登记，并对公司处5万元以上50万元以下罚款；对直接责任人处3万元以上25万元以下罚款。
     

实务建议：

• 公司若因内部争议（如股东分歧）无法达成变更决议，应通过股东会或诉讼解决争议，而非拖延登记，否则可能面临行政处罚。
  
• 若市场监管局已启动处罚程序，公司可主动配合调查、补办登记，争取从轻或减轻处罚（如首次违法、主动整改）。
  

提示：具体处罚需结合违法情节、地方执行标准综合判断，若有进一步疑问，可直接向我咨询具体场景下的法律风险。