关于工厂请假扣加班费的问题，核心结论需结合具体请假类型、工厂规章制度及劳动合同约定综合判断，以下分情况说明：

1. 请假类型与加班费扣除的关联性

   • 事假：通常为无薪假，若员工当月存在加班事实，工厂可能按“请假天数折抵加班时长”的方式扣除加班费。例如：员工月加班20小时，请事假1天（按8小时计），工厂可能扣除8小时对应的加班费（需确保扣除后不低于当地最低工资标准）。
     
   • 病假：根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，病假期间工资不得低于当地最低工资的80%，工厂一般不得直接扣除加班费，但可能按比例折算绩效或奖金。
     
   • 年假/调休假：属于带薪假，工厂无权因员工休年假或调休假而扣除加班费，否则涉嫌违法。

2. 工厂规章制度的合法性审查

   • 若工厂规章制度明确规定“请假按比例扣除加班费”，需满足以下条件才合法：
     
     • 制度经民主程序制定（如职工代表大会讨论）；
       
     • 内容不违反法律强制性规定（如扣除后工资不低于最低工资）；
       
     • 已向员工公示或告知（如签字确认、系统公告）。
       
   • 若制度违法：例如直接规定“请假1天扣3天加班费”，员工可主张按实际请假时长折算，并要求补发差额。

3. 劳动合同的优先适用原则

   • 若劳动合同中约定了“请假与加班费扣除的具体规则”，且该约定不违反法律强制性规定（如不低于最低工资），则以合同为准。
     
   • 例外情形：若合同条款显失公平（如“请假即扣除全部加班费”），员工可依据《劳动合同法》第38条主张解除合同并要求经济补偿。

建议行动：

• 核对工厂规章制度及劳动合同中关于请假与工资的条款；
  
• 保留请假记录、工资条等证据；
  
• 若发现扣除不合理，可先与工厂协商，协商不成可向当地劳动监察大队投诉或申请劳动仲裁。
  

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