在民事案件运输合同纠纷中，若被告伪造证据且法院已作出判决，原告选择报警，需要准备以下材料以支持其指控：
基础证据材料：
- 报警材料：首先，原告需要准备一份详细的报警材料，说明案件的基本情况，包括运输合同纠纷的背景、被告伪造证据的具体事实、伪造证据的内容（如伪造的合同、签收单、运输记录等）、伪造证据对案件判决的影响，以及原告因此遭受的损失等。
- 身份证明：提供原告的身份证明文件，如身份证复印件，以证明原告的身份和诉讼主体资格。
与案件相关的证据材料：
- 原始合同及履行证据：提供原始的运输合同、发货单、签收单、运输记录等，以证明运输合同的真实存在及履行情况。
- 伪造证据的对比材料：将被告伪造的证据与原始证据进行对比，突出伪造证据与原始证据之间的差异，如签名不一致、内容矛盾、时间不符等。
- 专家鉴定意见：如果可能，可以聘请相关领域的专家对伪造证据进行鉴定，并出具鉴定意见，以证明证据的伪造性。
- 证人证言：如果有目击者或知情人士，可以提供他们的证言，以支持原告的指控。
法院判决及执行材料：
- 法院判决书：提供法院对运输合同纠纷的判决书，以证明案件已经经过法院审理并作出判决。
- 执行情况说明：如果判决已经生效且进入执行阶段，提供执行情况说明，包括执行申请书、执行裁定书等，以证明被告伪造证据对判决执行的影响。
其他辅助材料：
- 损失计算依据：如果原告因被告伪造证据而遭受了经济损失，需要提供损失的计算依据，如经济损失的计算公式、相关票据等。
- 其他相关证据：根据案件具体情况，可能还需要提供其他与案件相关的证据材料，如通信记录、电子邮件、短信等，以证明被告伪造证据的行为。
在准备这些材料时，原告需要注意以下几点：
- 确保材料的真实性和完整性：所有提供的材料必须真实可靠，不得有任何虚假或隐瞒。同时，要确保材料的完整性，不要遗漏任何关键信息。
- 及时报警并配合调查：在准备好相关材料后，原告应及时向公安机关报警，并积极配合公安机关的调查工作。
- 咨询专业律师：由于涉及法律程序和证据规则，原告在准备材料和报警前最好咨询专业律师的意见，以确保材料的准备和报警行为的合法性和有效性。
若公安机关立案侦查后，被告可能面临的法律后果：
- 刑事责任：如果被告伪造证据的行为构成犯罪，如伪造证据罪，将可能面临刑事处罚，包括有期徒刑、拘役、罚金等。
- 民事责任：即使被告的行为不构成犯罪，也可能因伪造证据而承担民事责任，如赔偿原告因此遭受的损失、承担诉讼费用等。
最后，我建议原告在准备材料和报警前，务必咨询专业律师的意见，以确保自身权益得到充分保护。如果你有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。