结论：倒查13年招投标工程老板是否有罪，不能一概而论，需根据具体情况判断其是否存在违法行为及法律责任。以下从多个角度进行分析：
一、法律追诉时效的角度
刑事追诉时效：
- 根据《中华人民共和国刑法》第八十七条的规定，犯罪经过下列期限不再追诉：
- 法定最高刑为不满五年有期徒刑的，经过五年；
- 法定最高刑为五年以上不满十年有期徒刑的，经过十年；
- 法定最高刑为十年以上有期徒刑的，经过十五年；
- 法定最高刑为无期徒刑、死刑的，经过二十年。如果二十年以后认为必须追诉的，须报请最高人民检察院核准。
- 如果工程老板在招投标过程中涉及的犯罪行为，如串通投标罪、行贿罪等，其法定最高刑在十年以上有期徒刑的，那么经过十五年后，原则上不再追诉。但若认为必须追诉的，需报请最高人民检察院核准。
行政处罚时效：
- 根据《中华人民共和国行政处罚法》第三十六条的规定，违法行为在二年内未被发现的，不再给予行政处罚；涉及公民生命健康安全、金融安全且有危害后果的，上述期限延长至五年。法律另有规定的除外。
- 对于招投标过程中的违法行为，如未按照规定进行招投标、串通投标等，如果行政机关在二年内（或五年内，如涉及特定领域）未发现，则不再给予行政处罚。
二、违法行为性质与情节的角度
违法行为性质：
- 如果工程老板在招投标过程中存在严重的违法行为，如串通投标、行贿受贿、弄虚作假等，且这些行为被依法认定为犯罪，那么无论时间过去多久（在追诉时效内），都可能面临刑事处罚。
违法行为情节：
- 违法行为的情节轻重也是判断是否构成犯罪及法律责任大小的重要因素。例如，串通投标罪的成立，通常要求行为人之间存在串通行为，且该行为影响了招投标的公正性。如果情节显著轻微，可能不构成犯罪，但可能面临行政处罚。
三、证据收集与保存的角度
证据收集：
- 在倒查招投标过程中的违法行为时，证据的收集是关键。如果能够收集到充分的证据证明工程老板存在违法行为，那么即使时间过去较久，也可能依法追究其责任。
证据保存：
- 证据的保存同样重要。如果相关证据因时间久远而灭失或难以收集，那么可能影响对违法行为的认定和追究。
四、实际操作中的考虑
法律程序：
- 在实际操作中，即使发现工程老板在招投标过程中存在违法行为，也需要按照法律程序进行调查、取证、起诉和审判。这可能需要一定的时间和资源。
社会影响：
- 对于涉及重大公共利益或社会影响的招投标案件，即使时间过去较久，也可能因为社会舆论或公众关注而得到重新审视和处理。
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