交通肇事罪在大多数情况下会被提起公诉，但也存在不会被提起公诉的特殊情形。以下是对这一问题的详细分析：

一、交通肇事罪通常会被提起公诉

交通肇事罪是指违反交通运输管理法规，因而发生重大事故，致人重伤、死亡或者使公私财产遭受重大损失的行为。此罪行不仅侵犯了个人的人身和财产权利，还严重危害了公共安全。在大多数情况下，如果交通肇事造成重大伤亡或财产损失且涉嫌犯罪，公安机关会立案侦查，并在侦查终结后移送检察机关审查起诉。检察机关认为犯罪嫌疑人的犯罪事实已经查清，证据确实、充分，依法应当追究刑事责任的，会作出起诉决定，向人民法院提起公诉，以维护社会公共利益和法律秩序。

二、不会被提起公诉的特殊情形

尽管交通肇事罪通常会被提起公诉，但也存在一些特殊情形，使得检察机关可能作出不起诉决定。这些情形主要包括：

1. 情节显著轻微、危害不大，不认为是犯罪：

   • 如果交通肇事行为造成的损害后果非常轻微，例如仅造成轻微的财产损失，且没有人员伤亡，同时行为人积极赔偿损失并取得被害人谅解等，可能被认为情节显著轻微、危害不大，不构成犯罪，因此不会被提起公诉。

2. 存在法定不起诉情形：

   • 犯罪已过追诉时效期限：交通肇事罪的追诉时效根据其可能判处的刑罚不同而有所差异。如果犯罪行为发生后经过了一定的时间，超过了法律规定的追诉时效期限，那么检察机关可以依法作出不起诉决定。
   • 经特赦令免除刑罚：在国家发布特赦令的情况下，如果交通肇事犯罪嫌疑人符合特赦的条件，可以被免除刑罚，从而不会被提起公诉。
   • 犯罪嫌疑人、被告人死亡：如果在案件办理过程中，犯罪嫌疑人或被告人死亡，刑事诉讼活动就无法继续进行，检察机关会依法作出不起诉决定。

3. 具有酌定不起诉情形：

   • 犯罪情节轻微：当交通肇事行为虽然构成犯罪，但情节相对较轻，例如事故责任认定为主要责任而非全部责任，且造成的损害后果不是特别严重，同时行为人具有自首、立功、积极赔偿被害人损失并取得谅解等情节时，检察机关可能会认为其犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚，从而作出不起诉决定。
   • 依照刑法规定可以免除刑罚：在某些特殊情况下，即使交通肇事行为构成犯罪，但根据刑法的相关规定可以免除刑罚。例如，行为人在犯罪后主动投案自首，如实供述自己的罪行，并且积极采取措施避免更严重的后果发生，有可能被检察机关认定为符合免除刑罚的条件而不予起诉。

三、举例说明

以张三为例，如果张三在驾驶机动车时严重超速并闯红灯，与其他车辆发生碰撞，导致多人重伤和车辆严重受损的重大事故，且经交警部门认定张三负事故的全部责任。此时，张三的行为构成交通肇事罪，且情节严重，检察机关会依法提起公诉。然而，如果张三在小区内低速行驶时，不小心剐蹭到他人的车辆，造成了较小的车漆损伤，且双方通过协商达成赔偿协议，那么张三的行为可能被认为情节显著轻微、危害不大，不构成犯罪，因此不会被提起公诉。

综上所述，交通肇事罪在大多数情况下会被提起公诉，但也存在不会被提起公诉的特殊情形。在处理交通肇事罪案件时，应充分考虑各种法定情形和实际情况，以确保法律的公正适用。如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。