关于同一件事由两个不同部门出具的证据，其法律效力问题，结论是：不同部门出具的证据，只要符合法律规定的证据形式和条件，均具有法律效力，但具体效力的认定需结合证据的种类、内容、收集程序及案件具体情况综合判断。以下从多个角度详细分析：
一、证据的法律效力基础
根据我国《民事诉讼法》及相关司法解释，证据是指能够证明案件事实的材料。证据的种类包括但不限于书证、物证、视听资料、电子数据、证人证言、鉴定意见、勘验笔录等。无论证据由哪个部门出具，只要其符合法律规定的证据形式，且内容真实、来源合法、与案件事实相关联，就具有法律效力。
二、不同部门出具证据的效力差异
证据种类与形式：
- 不同部门出具的证据，可能属于不同的证据种类。例如，公安机关出具的询问笔录属于证人证言类证据，而鉴定机构出具的鉴定意见则属于鉴定意见类证据。
- 不同种类的证据，在证明力上可能存在差异。但这种差异并非由出具部门决定，而是由证据本身的性质、内容及收集程序等因素决定。
证据收集程序：
- 证据的收集程序对其法律效力有重要影响。例如，非法收集的证据可能被排除在法庭之外，不具有法律效力。
- 不同部门在收集证据时，需遵循各自的法定程序。只要程序合法，其出具的证据就具有法律效力。
证据内容与关联性：
- 证据的内容必须真实、准确，且与案件事实相关联。无论由哪个部门出具，如果证据内容虚假或与案件无关，其法律效力将受到质疑。
- 在判断证据效力时，法院会综合考虑证据的内容、来源、收集程序及与其他证据的关联性等因素。
三、具体情境下的效力认定
同一事实由不同部门出具不同证据：
- 在这种情况下，法院会综合审查各证据的内容、来源、收集程序及关联性，以确定其证明力。
- 如果各证据之间相互印证，形成完整的证据链，则法院可能采纳这些证据来认定案件事实。
同一事实由不同部门出具相似证据：
- 如果不同部门出具的证据在内容上相似或一致，法院会进一步审查这些证据的收集程序、来源及真实性等，以确定其是否均具有法律效力。
- 在某些情况下，法院可能认为这些证据相互支持，增强了对案件事实的证明力。
证据冲突与排除：
- 如果不同部门出具的证据在内容上存在冲突，法院会根据证据的证明力大小、收集程序的合法性等因素进行综合判断，以确定哪些证据应被采纳。
- 在某些情况下，法院可能排除部分或全部证据，以避免对案件事实的错误认定。
四、建议与注意事项
确保证据合法性：
- 无论由哪个部门出具证据，都应确保其收集程序合法、内容真实、来源可靠。
- 避免使用非法手段收集证据，以免证据被排除在法庭之外。
综合审查证据：
- 在诉讼过程中，应综合审查所有相关证据，包括不同部门出具的证据，以形成对案件事实的全面认识。
- 注意证据之间的关联性、一致性及矛盾点，以便在法庭上有效陈述和辩论。
咨询专业律师：
- 在处理涉及复杂证据问题的案件时，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。
- 作为欧士磊律师，我擅长处理刑事辩护、合同纠纷、婚姻家庭、遗产继承、侵权纠纷、公司事务及民间借贷等领域的法律问题。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。