取保候审保证金不能由他人代为退还的情况可能涉及多个方面，以下是一些可能的原因及解释：
退还程序要求：
- 取保候审保证金的退还通常需要遵循一定的法律程序。这可能包括提交退还申请、提供相关证明文件（如取保候审决定书、保证金收据等），以及经过公安机关或检察机关的审核批准。
- 在这些程序中，可能明确要求保证金缴纳人本人亲自办理退还手续，以确保退还的准确性和合法性。如果由他人代为办理，可能因无法验证代办人的身份和授权而遭到拒绝。
身份验证与授权问题：
- 公安机关或检察机关在办理保证金退还时，需要对缴纳人的身份进行严格验证。如果由他人代为退还，可能因无法提供有效的身份证明或授权文件而被拒绝。
- 即使你提供了授权委托书等文件，也可能因委托书的格式、内容或签署方式不符合规定而被视为无效，从而导致退还申请被拒绝。
保证金管理规定：
- 根据相关法律法规和公安机关、检察机关的内部管理规定，取保候审保证金的退还可能受到特定条件的限制。例如，可能规定保证金必须在特定时间内退还，或者必须由缴纳人本人亲自领取。
- 如果这些规定中明确禁止了他人代为退还保证金，那么你的退还申请自然会被拒绝。
实际操作中的考虑：
- 在实际操作中，公安机关或检察机关可能出于安全、效率或其他方面的考虑，更倾向于让缴纳人本人亲自办理退还手续。这有助于减少因代办而可能产生的纠纷和风险。
针对你的情况，我建议采取以下措施：
- 了解具体原因：首先，你可以尝试联系办理取保候审的公安机关或检察机关，了解他们拒绝你父亲代为退还保证金的具体原因。这有助于你更准确地定位问题并找到解决方案。
- 准备必要文件：如果是因为身份验证或授权问题导致的拒绝，你可以准备有效的身份证明和授权委托书等文件，并确保这些文件符合相关规定的要求。
- 亲自办理或委托律师：如果可能的话，你最好亲自前往办理退还手续。如果你因故无法亲自前往，可以考虑委托一位专业律师代为办理。律师具有专业的法律知识和经验，能够更好地处理这类事务。
最后，需要强调的是，取保候审保证金的退还涉及法律程序和规定，务必确保所有操作都符合法律法规的要求。如果你在处理过程中遇到任何问题或困惑，可以直接向我咨询，我会根据你的具体情况提供专业的法律建议。