年休假应当视作出勤，且公司不应因此扣减员工的全勤奖或影响其他福利待遇。以下是从不同角度的详细分析：

1. 法规支持：

   • 根据《职工带薪年休假条例》第二条，员工在年休假期间享受与正常工作期间相同的工资收入。这明确表明，年假是带薪的，应视为正常工作时间，即出勤。
   • 《企业职工带薪年休假实施办法》第六条也强调，职工依法享受的年休假不计入其他假期，其性质与法定节假日相似，均属于带薪休息。这进一步支持了年休假应视作出勤的观点。

2. 全勤定义与年假性质：

   • 全勤通常指员工在规定出勤时间内按时到岗，无论是否完成工作任务。而年假作为员工的法定权利，是员工在连续工作一定时间后应享受的休息时间，不属于缺勤或旷工范畴。
   • 因此，从逻辑上讲，休年假并不违反全勤的定义，也不应被视为缺勤行为。公司应将年休假视为正常出勤，并据此支付相应的工资和福利待遇。

3. 年假与全勤奖的关系：

   • 法律虽未直接规定休年假是否影响全勤奖发放，但基于年假的带薪性质和全职工作的认定，实践中普遍认为休年假不应影响全勤考核。
   • 用人单位若以员工休年假为由扣减全勤奖，可能构成对员工合法权益的侵害。此类规定可能因违反法律法规而无效，员工有权要求公司按照全勤标准支付相应的全勤奖或其他福利待遇。

4. 特殊情况考虑：

   • 若员工在休年假的同时存在其他缺勤情况（如病假、事假等），这些缺勤可能会影响到全勤保底工资的发放。但这与仅因休年假而被扣减全勤奖的情况不同，公司应合理区分员工的不同缺勤类型，并依据合法有效的规章制度进行考勤管理和奖金发放。

综合建议：

• 查看公司规定：员工应首先查阅公司关于全勤和年假的具体规定，确保自身权益不受侵害。如果公司规定与法律法规相悖，员工有权要求公司进行修正。
• 沟通协商：若公司规定存在不合理之处，员工可与公司进行沟通协商，要求公司按照法律法规和公平原则进行考勤管理和奖金发放。
• 法律维权：在必要时，员工可通过劳动仲裁等法律途径维护自身合法权益，确保休年假不影响全勤认定及相应福利待遇的发放。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我将竭诚为你服务。