休年假在法律上应当算作出勤，且通常应计入全勤考核。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：
法律层面
带薪年休假性质：
- 根据《职工带薪年休假条例》第二条，员工在年休假期间享受与正常工作期间相同的工资收入。这表明年假是带薪的，且应视为正常工作时间的一部分。
- 年休假是法律赋予劳动者的合法权益，是劳动者可以正常享受的带薪休息时间，不属于无故缺勤或违反考勤规定的行为。
全勤定义与年假关系：
- 全勤一般指员工在一个考勤周期内，按照用人单位的考勤制度，正常出勤，未出现迟到、早退、旷工等违反考勤纪律的情况。
- 年休假作为员工的法定权利，其性质与法定节假日相似，均属于带薪休息，因此不应被视为缺勤行为，而应计入全勤考核。
实际操作层面
公司规章制度：
- 虽然法律上年假应计入全勤，但具体还需参考用人单位的规章制度或劳动合同中的相关约定。
- 如果用人单位依法制定的规章制度中明确规定年休假不计入全勤，并且该规章制度的制定程序合法（如经过民主程序制定，向劳动者公示或告知），内容不违反法律法规的强制性规定，那么在该单位内部可能会按照此规定执行。但这种情况相对较少，且可能面临法律风险，因为它可能与年休假制度保障劳动者权益的初衷相悖。
全勤考核与福利待遇：
- 在符合休假规定的前提下，员工休年假应视为出勤，不影响工资、奖金及福利待遇的发放。
- 如果公司因员工休年假而扣减全勤奖或影响其他福利待遇，可能构成对员工合法权益的侵害，员工有权通过法律途径维护自己的权益。
应对建议
查阅公司规定：
- 员工在休年假前，最好查阅自己公司的规章制度或劳动合同中关于全勤和年假的具体规定，以避免可能的误解或争议。
沟通协商：
- 如果因休年假是否算全勤产生争议，员工首先应与用人单位进行沟通协商，尝试达成共识。
法律维权：
- 若沟通无果，员工可以向劳动监察部门投诉，或者申请劳动仲裁委员会进行调解或仲裁，以维护自己的合法权益。
举例说明：假设某员工在公司工作满一年后，依法享受了5天的带薪年休假。在这5天里，员工没有迟到、早退或旷工，且按照公司规定完成了休假申请流程。那么，这5天应被视为员工的正常出勤时间，计入全勤考核，员工应享受与正常工作期间相同的工资收入和福利待遇。
综上所述，休年假在法律上应当算作出勤，且通常应计入全勤考核。员工在享受年假时，应了解自己的权益和公司的规定，确保自己的合法权益不受侵害。如有任何疑问或争议，可直接向我咨询。