行政复议机关在特定情形下可以自行撤销已生效的行政复议决定。以下是对这一问题的详细解答：
一、可撤销的情形
根据《中华人民共和国行政复议法》及相关规定，行政复议决定在以下情形下可以被撤销：
主要事实不清、证据不足：如果行政复议机关在作出复议决定时，所依据的主要事实不清楚或者证据不充分，那么该复议决定就可能因缺乏事实基础而被撤销。例如，复议机关在未充分调查取证的情况下就作出了对申请人不利的决定，这种决定就可能因证据不足而被撤销。
适用依据错误：如果行政复议机关在作出复议决定时，适用了错误的法律依据，如适用了已经废止或失效的法律条文，或者将法律条文适用于与其不相符的事实情况，那么该复议决定就可能因适用法律错误而被撤销。
违反法定程序：行政复议必须遵循法定的程序进行，包括受理申请、审查材料、听取意见、作出决定等环节。如果复议机关在复议过程中违反了这些法定程序，如未依法通知申请人参加听证会，或者未在规定期限内作出复议决定等，那么该复议决定就可能因程序违法而被撤销。
超越职权或滥用职权：行政复议机关必须在法律规定的权限范围内行使职权，不得超越其职权范围作出决定。同时，复议机关也不得滥用职权，如以权谋私、偏袒一方等。如果复议机关的行为超出了其职权范围或者滥用了职权，那么该复议决定就可能因此而被撤销。
具体行政行为明显不当：虽然“具体行政行为明显不当”并非直接作为撤销复议决定的法定理由，但在实践中，如果复议机关维持了明显不当的具体行政行为（如处罚过重或过轻），且该行为本身存在合理性问题，行政复议机关在发现后，也可以自行撤销原复议决定，并重新作出更合理的决定。
二、撤销的程序
行政复议机关自行撤销已生效的行政复议决定，通常遵循以下程序：
内部审查：由行政复议机关的内部监督部门或相关负责人对已生效的复议决定进行审查，确认是否存在上述可撤销的情形。
作出撤销决定：经审查确认存在可撤销情形的，行政复议机关应作出撤销原复议决定的决定，并制作撤销决定书。
送达与通知：将撤销决定书送达给相关当事人，并通知其原复议决定已被撤销，以及后续的处理方式（如重新作出复议决定等）。
三、撤销的后果
法律效力消灭：一旦行政复议决定被撤销，其法律效力即告消灭，不再对当事人产生约束力。
恢复原始状态：被撤销的复议决定所涉及的具体行政行为将恢复其原始状态，由作出该行为的行政机关重新处理或接受司法审查。
国家赔偿责任：如果因复议决定被撤销而给当事人造成损失的，相关责任主体（如行政复议机关或作出原具体行政行为的行政机关）可能需要承担国家赔偿责任。
四、实际操作建议
对于行政复议机关而言，在作出复议决定时应严格遵循法定程序和法律规定，确保决定的合法性和合理性。如果发现已生效的复议决定存在可撤销的情形，应及时启动内部审查程序并作出撤销决定，以维护当事人的合法权益和行政复议制度的公正性。
对于当事人而言，如果认为行政复议决定存在上述可撤销的情形，可以向行政复议机关提出异议或申请重新审查。如果行政复议机关未予处理或处理不当，还可以依法向人民法院提起行政诉讼以维护自己的合法权益。
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