加班审批单的保管责任通常在于用人单位，但具体保管方式及责任分配可能因公司制度或实际情况有所不同。以下从几个角度详细分析：

1. 用人单位的一般责任：

   • 根据劳动法的相关规定，用人单位有义务建立和完善劳动规章制度，这包括加班审批制度。加班审批单作为加班事实的直接证据，对于用人单位和劳动者双方都至关重要。因此，用人单位通常负责保管加班审批单，以确保在需要时能够提供完整的加班记录。
   • 从证据保存的角度来看，用人单位作为加班审批流程的发起者和执行者，有责任妥善保管相关审批单据，以备劳动争议时作为证据使用。

2. 劳动者可能涉及的保管情况：

   • 在某些情况下，劳动者可能也会保留加班审批单的复印件或电子版，作为自己加班的证明。然而，这并不改变用人单位作为主要保管责任方的地位。
   • 如果劳动者需要加班审批单作为个人记录或用于其他合法目的，他们可以向用人单位申请复印或获取电子版。但这并不意味着劳动者有义务保管原件。

3. 公司制度与实际操作：

   • 不同的公司可能有不同的加班审批和保管制度。一些公司可能要求劳动者在加班前提交加班审批单，并由部门负责人或人力资源部门审批后留存；而另一些公司则可能采用电子化审批系统，所有审批记录都保存在系统中。
   • 无论采用何种制度，用人单位都应确保加班审批单的完整性和可追溯性。这包括确保审批单的填写规范、审批流程的透明以及保管方式的可靠。

4. 法律后果与建议：

   • 如果用人单位未能妥善保管加班审批单，导致在劳动争议中无法提供有效证据，可能会面临不利的法律后果。根据《最高人民法院关于审理劳动争议案件适用法律问题的解释（一）》的相关规定，劳动者有证据证明用人单位掌握加班事实存在的证据而用人单位不提供的，由用人单位承担不利后果。
   • 因此，我建议用人单位建立完善的加班审批和保管制度，明确审批流程、保管责任以及查询和复制审批单的程序。同时，定期对加班审批单进行归档和备份，以确保其完整性和安全性。

综上所述，加班审批单的保管责任主要在于用人单位。用人单位应建立完善的制度来确保加班审批单的妥善保管和可追溯性，以应对可能的劳动争议。如果您在加班审批单保管方面遇到任何问题或需要进一步的法律建议，请随时向我咨询。