结论前置：一般情况下，用人单位不得因怀孕员工不胜任工作而直接辞退，但在特定情形下，如员工严重违反规章制度或存在其他法定解除情形时，用人单位可以依法解除劳动合同。
详细分析：
一、一般情况下的保护
根据《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，女职工在孕期、产期、哺乳期内的，享有特殊的法律保护。具体来说，用人单位不得因女职工怀孕而依据无过失性辞退（如不能胜任工作等情形）或经济性裁员的规定解除劳动合同。这一规定旨在保障女性员工在生理特殊时期能够得到应有的保护和照顾，确保她们的合法权益不受侵犯。
举例说明：假设一位怀孕员工因身体原因暂时无法胜任原岗位工作，用人单位不能直接以其不胜任工作为由解除劳动合同。相反，用人单位应当根据实际情况，考虑调整其工作岗位或安排其他合适的工作，以确保其权益不受损害。
二、特殊情况下的辞退
尽管怀孕女职工在一般情况下受到法律保护，但在以下特定情形下，用人单位可以依法解除劳动合同：
严重违反规章制度：如果怀孕女职工严重违反了公司的规章制度，如无故旷工、泄露商业秘密等，用人单位可以依据《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条的规定解除劳动合同。但需要注意的是，用人单位在解除劳动合同时，必须确保有确凿的证据支持，并遵循法定程序。
其他法定情形：除了严重违反规章制度外，如果怀孕女职工存在其他法定解除情形，如被依法追究刑事责任等，用人单位也可以依法解除劳动合同。
特别说明：对于不胜任工作这一情形，虽然《中华人民共和国劳动合同法》第四十条规定了因不能胜任工作而可以辞退的情形，但这一规定对怀孕女职工并不适用。也就是说，即使怀孕女职工确实因自身原因无法胜任工作，用人单位也不能直接以其不胜任工作为由解除劳动合同。然而，如果怀孕女职工经过培训或调整岗位后仍不能胜任工作，且存在其他法定解除情形（如严重违反规章制度等），用人单位在遵循法定程序的情况下，可以与其解除劳动合同。
三、违法辞退的法律后果
如果用人单位违反法律规定辞退怀孕员工，将面临以下法律后果：
继续履行合同：怀孕员工有权要求继续履行劳动合同，用人单位必须继续履行。
经济赔偿：若怀孕员工不要求继续履行合同或合同已无法继续履行，用人单位需按经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。经济补偿标准通常为每满一年支付一个月工资，六个月以上不满一年的按一年计算，不满六个月的支付半个月工资的经济补偿。
建议：作为用人单位，在处理与怀孕员工相关的劳动问题时，应充分了解并遵守相关法律法规的规定，尊重和保护女性员工的特殊权益。同时，也应根据实际情况进行具体分析，确保处理方式的合理性和合法性。如果您在这方面有具体的法律问题或疑虑，可以直接向我咨询，我会为您提供更准确的解答和帮助。