当您的摩托车因改装电机驱动被交警查处时，具体的处理方式及法律后果将依据改装的性质和严重程度来判定。以下是我为您详细梳理的处理流程与法律后果分析：

一、轻微改装且未影响安全性能的情况

如果您的改装仅涉及外观或某些非关键部件，且这些改动并未影响摩托车的整体安全性能（例如，仅仅是更换了车贴或加装了一些装饰性小部件），那么交警通常会采取以下措施：

1. 责令恢复原状：要求您将摩托车恢复至原出厂状态，以确保其符合道路交通安全标准。
2. 警告或罚款：根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，您可能会受到警告，或者被处以20元以上200元以下的罚款，具体金额由当地交通管理部门根据实际情况决定。

二、非法改装且影响安全性能的情况

若您的摩托车进行了涉及动力系统、底盘悬挂、结构等关键方面的改动，且这些改动影响了车辆的安全性能，那么这就构成了非法改装。对此，交警将依法采取更为严厉的措施：

1. 扣留车辆：执法人员有权依法扣留您的摩托车，直至您将车辆恢复到原来的登记状态。
2. 罚款：您可能会被处以200元以上2000元以下的罚款，具体金额将依据改装情节的严重程度来判定。
3. 扣分：在某些地区，非法改装还可能导致您的驾驶证被扣分，具体分数根据当地交通管理法规而定。
4. 吊销驾驶证：如果改装情节特别严重，您的驾驶证甚至可能被吊销。
5. 不予年检：非法改装的摩托车将无法通过车辆年检，若上路行驶，还会按驾驶未经检验合格机动车进行处罚。
6. 强制报废：若改装后的摩托车达到报废标准，公安机关交通管理部门将予以收缴，强制报废，并处以二百元以上二千元以下罚款，同时吊销您的机动车驾驶证。

三、特别提醒与建议

1. 刑事责任风险：如果您的改装行为涉及更严重的违法情况，如非法拼装或驾驶已达到报废标准的机动车等，您还可能面临刑事责任的追究。
2. 合规改装建议：为了避免不必要的麻烦和损失，我建议您不要擅自进行非法改装。如果您有改进需求，应咨询专业的摩托车维修店或改装店，并确保所有改装都符合相关法律法规的要求。
3. 关注政策动态：车主应时刻关注当地交通管理部门的最新规定和政策动态，以确保摩托车始终保持在合法合规的状态。

综上所述，摩托车改装电机驱动被交警查处后，将面临一系列严格的法律后果。因此，我强烈建议您在改装前务必了解相关法律法规，确保改装行为合法合规，以免给自己带来不必要的法律风险和经济损失。