物流企业在代理报关时，并非必须与货物所有人签订合同，但需根据具体业务模式和法律关系来确定。以下分情况详细说明：

1. 直接代理报关模式
   若物流企业以货物所有人的名义直接向海关办理报关手续（即显名代理），此时法律关系相对清晰：货物所有人是报关行为的直接责任方，物流企业仅作为代理人。这种情况下，合同签订并非强制要求，但实务中为明确双方权利义务（如报关资料提供、费用承担、责任划分等），通常会签订书面代理合同。若未签订合同，一旦发生纠纷（如报关资料错误导致罚款），可能因权责不明陷入举证困境。

2. 间接代理报关模式
   若物流企业以自己的名义向海关办理报关手续，但实际委托方为货物所有人（即隐名代理），此时法律关系更为复杂。根据《民法典》第九百二十五条，若第三方（海关）在订立合同时知道代理关系，则合同直接约束货物所有人与第三方；若不知情，则可能由物流企业先行承担责任，再向货物所有人追偿。为规避风险，此类模式下建议签订书面合同，明确代理权限、责任承担等条款，否则物流企业可能因“表见代理”承担额外责任。

3. 特殊场景：无单放货或报关行自行报关
   若物流企业同时承担运输、仓储等综合服务，且报关行为属于其服务链条的一部分（如FOB术语下卖方委托货代报关），此时物流企业与货物所有人可能已存在运输合同或仓储合同，报关义务可能被涵盖其中，无需单独签订报关合同。但若报关行为超出原有合同范围（如应货物所有人要求额外办理某类许可），则需补充签订委托协议。

实务建议：

• 无论何种模式，书面合同是明确权责的最佳工具，尤其需注意约定“报关资料真实性承诺”“海关罚款承担”“不可抗力免责”等条款；
  
• 若货物所有人为境外主体，建议合同中明确适用法律及争议解决方式（如仲裁条款），避免跨境诉讼成本；
  
• 物流企业需留存报关委托书、货物所有权证明（如提单、发票）等文件，以证明代理关系合法性。
  

如有具体业务场景或合同条款需要进一步分析，可直接向我咨询。