关于您提出的“农村宅基地纠纷协议村委会盖章是否有效”的问题，以下是我的详细解答：

首先，我们需要明确的是，农村宅基地的买卖或转让必须遵循相关法律法规，并且需要得到相关部门的批准和认可。在这个过程中，村委会的盖章并不能直接决定合同的有效性。

根据《土地管理法》的相关规定，买卖或者以其他形式非法转让土地的，由县级以上人民政府自然资源主管部门负责处理，包括没收违法所得、限期拆除非法建筑、恢复土地原状、罚款以及追究相关责任人员的法律责任等。这意味着，宅基地的买卖或转让行为，必须得到县级以上人民政府自然资源主管部门的批准和监管，而不是仅仅依赖于村委会的盖章。

那么，在宅基地纠纷协议中，村委会的盖章扮演什么角色呢？一般来说，村委会作为基层群众自治组织，可以在一定程度上参与和协调宅基地纠纷的解决。如果双方当事人在协商过程中达成了协议，并且希望村委会作为见证或调解方盖章确认，那么村委会的盖章可以作为一种辅助性的证明，表明双方当事人已经就纠纷达成了某种程度的共识。

然而，这种盖章并不具有法律上的强制执行力或决定性作用。如果协议内容违反了相关法律法规或损害了国家、集体的利益和其他村民的合法权益，那么即使村委会盖章确认，该协议也是无效的。

因此，在处理农村宅基地纠纷时，建议双方当事人首先通过协商解决问题，并尽量达成书面协议。如果协商不成，可以向当地乡（镇）政府或土地管理所等受理机关提出处理申请，并按照相关规定提交相关材料和证据。在处理过程中，应尊重历史、相互谦让，并遵守相关法律法规和程序规定。

综上所述，农村宅基地纠纷协议中村委会的盖章并不能直接决定合同的有效性。在处理宅基地纠纷时，应遵循相关法律法规和程序规定，并寻求专业法律意见和帮助。