针对您提出的“同等责任电瓶车主受伤，不认可判定的情况下应怎样处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，如果您对交警部门出具的《道路交通事故认定书》中的责任划分不认可，您有权在收到认定书之日起三日内向上一级公安机关交通管理部门提出书面复核申请。复核申请应当详细阐述您不认可的理由和依据，并附上相关证据材料。上一级公安机关交通管理部门会在收到复核申请后，对原认定书进行审查，并根据审查结果作出复核结论。
在等待复核结果期间，您仍需关注自身的伤势治疗和康复情况，并妥善保存好所有与事故相关的医疗费用单据、诊断证明、误工证明等证据材料。这些材料在后续的赔偿协商或诉讼过程中将起到至关重要的作用。
如果复核结果仍然维持原认定书的责任划分，而您仍然不认可，那么您可以考虑通过法律途径来维护自己的权益。具体来说，您可以向法院提起民事诉讼，要求对方承担相应的民事赔偿责任。在诉讼过程中，法院会重新审查事故责任划分和民事赔偿责任的认定，并根据相关法律法规和证据材料作出公正的判决。
在诉讼过程中，您需要注意以下几点：
充分准备证据：除了之前保存的医疗费用单据、诊断证明等证据外，您还可以收集事故现场的照片、视频、证人证言等证据，以证明事故发生的经过和对方的过错程度。
明确诉讼请求：在起诉状中，您需要明确列出自己的诉讼请求，包括要求对方赔偿的医疗费、误工费、残疾赔偿金、精神损害抚慰金等具体金额和计算方式。
遵循法律程序：在诉讼过程中，您需要遵循法院的诉讼程序和规定，按时出庭、提交证据、参与调解等。同时，您也可以委托律师代理诉讼，以更好地维护自己的权益。
最后，我想强调的是，无论您选择哪种方式来处理这个问题，都需要保持冷静和理性。交通事故责任划分和民事赔偿责任的认定是一个复杂而严谨的过程，需要依据相关法律法规和证据材料进行综合判断。因此，在处理这个问题时，请务必保持耐心和信心，相信法律会给您一个公正的答案。