针对您提出的问题“不是户主签字且双方进村委会证明签字但没有盖章，多年以后是否有效”，这主要涉及到的是协议或证明文件的法律效力问题。以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确的是，协议或证明文件的法律效力并不完全取决于是否盖章或户主签字，而是更多地取决于文件内容是否真实反映了各方的意愿，以及是否符合相关法律法规的规定。

1. 签字与盖章的法律意义：

   • 签字是确认文件内容、表达个人意愿的一种方式。在协议或证明文件中，签字通常被视为对文件内容的认可和接受。
   • 盖章则更多地是一种形式上的确认，用于证明文件的正式性和权威性。然而，并非所有文件都必须盖章才具有法律效力。

2. 非户主签字的影响：

   • 如果非户主在协议或证明文件上签字，且该签字得到了相关方的认可（如通过事后追认、口头确认或其他方式），那么该签字仍然可能具有法律效力。
   • 关键在于签字人是否具有代表相关方签字的权限或得到了相关方的明确授权。

3. 村委会证明的作用：

   • 村委会作为基层群众性自治组织，其出具的证明文件在一定程度上具有证明力。
   • 如果村委会在证明文件上签字（即使没有盖章），且该证明内容真实、合法，那么该证明文件仍然可能被视为有效证据。

4. 多年以后的有效性：

   • 协议或证明文件的有效性并不因其存在时间的长短而改变。只要文件内容真实、合法，且符合相关法律法规的规定，那么该文件在多年以后仍然可能具有法律效力。
   • 然而，如果文件内容存在争议或违反了法律法规的规定，那么其法律效力可能会受到质疑。

5. 建议与注意事项：

   • 为了确保协议或证明文件的法律效力，建议各方在签字前仔细阅读文件内容，确保理解并同意其中的条款。
   • 如果可能的话，尽量在文件上加盖公章或相关方的个人印章，以增加文件的正式性和权威性。
   • 对于重要的协议或证明文件，建议咨询专业律师或法律机构的意见，以确保其合法性和有效性。

总结：不是户主签字且双方进村委会证明签字但没有盖章的文件，在多年以后是否有效，取决于文件内容是否真实反映了各方的意愿、是否符合相关法律法规的规定，以及是否得到了相关方的认可。如果文件内容真实、合法，且得到了相关方的认可，那么该文件在多年以后仍然可能具有法律效力。