农村小二型水库承包50年一般不合法。具体分析如下：
承包期限的法律规定：
- 根据《中华人民共和国民法典》及相关法律法规，对于农村土地（包括水库等水利设施所占用的土地）的承包经营权，其承包期限通常受到严格限制。一般来说，农村土地承包经营权的期限不会超过法定的最长期限，如耕地承包期为三十年，草地承包期为三十年至五十年，林地承包期为三十年至七十年等。对于水库这类特殊的水利设施，其承包期限往往更短，且需遵循特定的法律法规。
水库承包的特殊性：
- 水库作为重要的水利设施，其管理和使用不仅关系到承包者的利益，更关系到周边地区的防洪安全、水资源利用和生态环境保护。因此，水库的承包经营通常受到更为严格的监管和限制。在多数情况下，水库的承包期限会远低于50年，甚至可能只有几年到十几年不等。
合法性的判断：
- 要判断农村小二型水库承包50年是否合法，需要具体查看承包合同的内容以及相关法律法规的规定。如果承包合同中的期限超过了法定最长期限，或者违反了相关法律法规对于水库承包的特殊规定，那么该承包合同就是不合法的。
建议与注意事项：
- 对于想要承包农村小二型水库的个人或单位，建议在签订承包合同前，务必仔细研究相关法律法规，了解水库承包的合法期限和特殊要求。同时，也可以咨询当地的水利部门或法律专业人士，以确保承包合同的合法性和有效性。
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