针对“卖假种子证据不足能立案吗”这一问题，结论前置如下：
- 证据不足时，一般难以直接立案。但若存在其他使生产遭受较大损失的情形，且这些情形有足够证据支持，则仍有可能立案。
- 立案的关键在于是否满足法定立案标准，而非单纯依赖证据是否充分。证据不足时，需结合其他因素综合判断。
详细分析如下：
一、证据不足与立案的关系
在刑事案件中，证据是立案、侦查、起诉和审判的基础。对于卖假种子的案件，若证据不足，即无法充分证明犯罪嫌疑人存在销售假种子的行为，或者无法证明该行为与生产遭受的损失之间存在因果关系，那么一般难以直接立案。然而，这并不意味着证据不足就绝对无法立案。
二、立案的法定标准
根据《最高人民检察院、公安部关于公安机关管辖的刑事案件立案追诉标准的规定（一）》以及《中华人民共和国刑法》的相关规定，销售假种子涉嫌触犯生产、销售伪劣农药、兽药、化肥、种子罪，立案标准主要包括以下两点：
使生产遭受损失二万元以上：
- 这意味着因使用假种子导致的农作物产量减少、品质降低或直接经济损失达到或超过二万元，即构成立案标准。
- 损失的计算通常基于农作物减产的数量、农产品品质下降的程度以及由此导致的农业收入减少等实际情况。
其他使生产遭受较大损失的情形：
- 这是一个相对宽泛的标准，旨在涵盖除直接经济损失外，对农业生产造成的其他重大影响。
- 例如，伪劣种子可能导致的土壤污染、生态环境破坏等间接损失，或者对农民的生产积极性和信心造成的严重打击。
- 具体判断需由司法机关根据案件的具体情况，综合考虑各种因素进行。
三、证据不足时的处理
当证据不足时，司法机关可能会采取以下措施：
进一步调查取证：
- 司法机关可能会要求报案人或控告人补充相关证据，或者自行开展进一步的调查取证工作，以收集更多能够证明犯罪嫌疑人存在销售假种子行为的证据。
结合其他因素综合判断：
- 在证据不足的情况下，司法机关可能会结合案件的其他情况，如犯罪嫌疑人的过往行为、销售假种子的规模、对农业生产的影响程度等，进行综合判断，以决定是否立案。
不立案或撤销案件：
- 若经过进一步调查取证后，仍无法收集到足够证据证明犯罪嫌疑人存在销售假种子的行为，或者无法证明该行为与生产遭受的损失之间存在因果关系，那么司法机关可能会决定不立案或者撤销案件。
四、法律建议
对于报案人或控告人：
- 在报案或控告时，应尽可能提供详细的证据材料，如购买假种子的凭证、假种子的样品、农作物减产或绝收的证明等，以协助司法机关查明事实。
- 若证据不足，应积极配合司法机关的调查取证工作，提供可能的线索或证据来源。
对于犯罪嫌疑人：
- 若被指控销售假种子，应积极行使自己的辩护权利，提供无罪或罪轻的证据材料。
- 若证据确实不足，且自己确实未实施销售假种子的行为，可以向司法机关提出不立案或撤销案件的申请。
最后需要强调的是，每个案件的具体情况都有所不同，证据不足时能否立案需结合案件的具体情况进行综合判断。若您遇到此类问题，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。