在电动车与机动车发生碰撞，且机动车负主责、电动车负次责的情况下，医药费的承担需遵循以下原则和步骤：

1. 交强险优先赔付：

   • 机动车必须投保的交强险，对受害人（包括电动车一方）的损失进行基本保障，且不区分责任比例。医疗费用赔偿限额一般为1.8万元（具体数额可能因地区和时间调整）。
   • 电动车一方的医疗费用首先由机动车一方的交强险在限额内全额赔偿。这意味着，如果电动车的医疗费用在1.8万元以内，那么全部费用都将由机动车的交强险承担。

2. 超出交强险限额部分的赔偿：

   • 如果电动车的医疗费用超出了交强险的赔偿限额，那么超出部分将按照双方的责任比例进行分担。
   • 在机动车主责、电动车次责的情况下，具体责任比例可能因地区和案件差异而有所不同，但常见比例为机动车承担60%-70%，电动车承担30%-40%。不过，由于题目中明确机动车主责、电动车次责，我们可以假设一个相对常见的比例，如机动车承担70%，电动车承担30%（但实际比例应根据当地法律法规和案件具体情况确定）。
   • 计算公式：超出交强险限额的医疗费用 × 电动车责任比例 = 电动车自行承担的医药费；超出交强险限额的医疗费用 × 机动车责任比例 = 机动车需承担的医药费（这部分可由商业险进一步覆盖）。
   • 举例：假设电动车医疗费用总额为3万元，交强险已赔偿1.8万元，剩余1.2万元。若按机动车70%、电动车30%的比例分担，则机动车需承担1.2万元 × 70% = 0.84万元，电动车自行承担1.2万元 × 30% = 0.36万元。

3. 商业险的补充赔偿：

   • 如果机动车一方投保了商业第三者责任险，那么其按责任比例应承担的赔偿金额（如上述的0.84万元）可由商业险在保险限额内进行支付。
   • 商业险的赔偿限额根据保险合同约定，通常较高，足以覆盖大部分赔偿需求。

4. 赔偿范围与证据要求：

   • 医疗费用包括住院费、手术费、药品费等实际产生的费用，以及因治疗产生的其他合理费用，如护理费、交通费等。
   • 所有费用应以正规发票为准，作为赔偿计算的依据。

5. 纠纷解决途径：

   • 双方可首先尝试通过协商或调解解决赔偿纠纷，这是高效且成本较低的方式。
   • 若协商无果，电动车一方或机动车一方均可向人民法院提起民事诉讼。法院将根据事故具体情况、双方提供的证据及相关法律法规作出公正判决。

总结与建议：

• 在处理此类交通事故赔偿时，建议首先确认交强险的赔付情况，然后根据责任比例分担超出交强险限额的医疗费用。
• 如果机动车一方投保了商业险，那么其应承担的赔偿金额可由商业险进行支付。
• 双方应保留好所有医疗费用的正规发票，作为赔偿计算的依据。
• 如遇纠纷，可先尝试协商或调解解决，若无法达成一致，可向人民法院提起诉讼。

如果有任何进一步的问题或需要具体的法律帮助，请随时向我咨询。