在既有单位犯罪又有个人犯罪的情况下，可以仅认定单位自首，但需满足单位自首的特定条件，且个人犯罪部分需另行处理。以下是对此问题的详细分析：
一、单位自首的认定条件
根据《最高人民法院关于处理自首和立功具体应用法律若干问题的解释》第一条的规定，单位犯罪同样可以认定自首，但需满足以下条件：
自动投案：
- 单位集体决定或者单位负责人决定而自动投案，这体现了单位的整体意志。
- 代表单位实施犯罪的直接主管人员自动投案，这些人员在单位犯罪中起着关键作用，他们的投案行为可以视为单位的投案。
- 单位未自动投案，但如实交代办案机关未掌握的单位犯罪事实，这表明单位在未被司法机关发觉或掌握其犯罪事实时，主动向司法机关坦白交代。
- 单位犯罪后逃跑，在被通缉、追捕过程中主动投案，即使单位在犯罪后试图逃避法律责任，但在被通缉或追捕过程中能够主动投案，仍然可以被认定为自首。
- 经查实确已准备去投案，或者已在投案途中，被公安机关捕获，这显示了单位有投案的意愿和行为，只是由于客观原因未能成功投案。
如实供述罪行：
- 单位在自动投案后，必须如实供述自己的罪行，这是自首的核心要件之一。
- 如实供述的罪行必须是司法机关还未掌握的本人其他罪行，如果单位如实供述的是司法机关已经掌握的罪行，则不能认定为自首，但可以酌情从轻处罚。
二、个人犯罪与单位自首的关系
在既有单位犯罪又有个人犯罪的情况下，单位自首的认定并不影响个人犯罪的独立处理。个人犯罪部分需根据个人的犯罪事实、情节及认罪态度等，依法进行定罪量刑。单位自首的认定，仅针对单位犯罪部分，对个人犯罪部分不产生直接影响。
三、法律后果
对于自首的单位，根据刑法的规定，可以从轻或者减轻处罚。其中，犯罪较轻的，可以免除处罚。这一规定体现了我国刑法对自首制度的鼓励和支持，旨在通过自首制度促使犯罪分子主动归案，节约司法资源，提高司法效率。然而，这一法律后果仅适用于单位犯罪部分，个人犯罪部分需根据个人情况另行处理。
四、实际操作中的注意事项
- 区分单位意志与个人意志：在认定单位自首时，需严格区分单位意志与个人意志，确保单位自首的认定是基于单位的整体意志，而非个别成员的个人行为。
- 全面收集证据：在认定单位自首时，需全面收集证据，包括单位自动投案的证据、如实供述罪行的证据等，以确保自首认定的准确性和合法性。
- 个人犯罪的独立处理：在既有单位犯罪又有个人犯罪的情况下，需对个人犯罪部分进行独立处理，确保个人犯罪的定罪量刑不受单位自首认定的影响。
总结来说，在既有单位犯罪又有个人犯罪的情况下，可以仅认定单位自首，但需满足单位自首的特定条件，且个人犯罪部分需另行处理。如有更多疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。