结论：无权代理合同中被代理人接受了工程款，该合同的效力取决于被代理人的追认行为。若被代理人追认，则合同自始有效；若拒绝追认，则合同对被代理人不发生效力，且无权代理人可能需承担赔偿责任。在特定情况下，如构成表见代理，即使被代理人未追认，合同也可能被视为有效。
一、被代理人追认的情况
合同效力：若被代理人对无权代理行为进行追认，该合同将自始有效，直接约束被代理人和相对人。这意味着，被代理人需按照合同约定履行相应的义务，如支付工程款等。
追认方式：追认可以是明示的，如通过书面或口头方式明确表示；也可以是默示的，如被代理人以实际行动履行了合同中的义务，如接受工程款。在此案例中，被代理人接受了工程款，可视为对无权代理行为的默示追认。
无权代理人的免责：一旦合同被追认，无权代理人不再承担责任，因为其行为已得到被代理人的认可。
二、被代理人拒绝追认的情况
合同效力：若被代理人明确表示拒绝追认或在催告期内未作表示（视为拒绝追认），则合同对被代理人不发生效力。这意味着，被代理人无需履行合同中的义务，如支付工程款。
无权代理人的责任：无权代理人需对相对人因信赖合同有效而遭受的损失承担赔偿责任。赔偿范围一般包括相对人为准备履行合同而支出的合理费用等，但不得超过被代理人追认时相对人所能获得的利益。在此案例中，若被代理人拒绝追认，无权代理人可能需对相对人因工程款支付问题而遭受的损失承担赔偿责任。
三、表见代理的特殊情况
定义与条件：表见代理是指虽然行为人事实上无代理权，但相对人有理由相信其有代理权而与其进行法律行为的情况。构成表见代理需满足两个条件：一是存在使相对人相信无权代理人具有代理权的客观表象；二是相对人主观上是善意且无过失。
法律后果：在表见代理的情况下，即使被代理人未追认，无权代理合同也视为有效合同，其法律后果由被代理人承担。之后，被代理人可以根据实际情况向无权代理人进行追偿。在此案例中，若构成表见代理，即使被代理人未明确追认，合同也可能被视为有效，被代理人需承担支付工程款的义务。
四、法律建议
对于相对人：在签订合同时，应仔细审查代理人的代理权限，确保合同的有效性。若发现代理人无权代理，应及时催告被代理人追认或行使撤销权，以保护自身权益。
对于被代理人：若发现无权代理行为，应及时明确表示拒绝追认，以避免不必要的法律纠纷。若已接受工程款等合同义务，则视为对无权代理行为的追认，需承担相应的法律责任。
对于无权代理人：应谨慎行使代理权，避免无权代理行为的发生。若因无权代理行为给相对人造成损失，应积极承担赔偿责任，以维护自身信誉和法律形象。
如有更多关于合同纠纷的法律问题，可以直接向我咨询。