结论概述：结合新闻背景，有方科技拟签订40亿重大合同，并计划于2025年11月14日召开第三次临时股东大会进行审议，表决程序是否合法需从股东大会召集程序、表决权行使、议案通过条件及信息披露义务四个方面综合判断。以下结合新闻背景及法律条文进行详细分析。

一、股东大会召集程序是否合法

1. 召集主体与权限：根据《公司法》第一百零一条，股东大会由董事会召集，董事长主持。若董事长不能履行职务或不履行职务，由副董事长主持；副董事长不能履行或不履行的，由半数以上董事共同推举一名董事主持。新闻背景中未提及召集主体存在异常，故可初步认为召集主体合法。

2. 召集时间与通知：根据《公司法》第一百零二条，召开股东大会会议，应当将会议召开的时间、地点和审议的事项于会议召开二十日前通知各股东；临时股东大会应当于会议召开十五日前通知各股东。新闻背景中，有方科技计划于2025年11月14日召开股东大会，若其已按法律规定提前通知股东，则召集时间合法。

二、表决权行使是否合法

1. 表决方式：新闻背景中提到，此次股东大会将采取现场投票与网络投票相结合的方式进行表决。根据《公司法》及相关规定，股东大会表决方式应确保股东能够充分行使表决权，现场投票与网络投票相结合的方式符合当前公司治理的实践要求，合法有效。

2. 表决权比例：对于重大经营合同的审议，通常属于特别决议事项，需经出席会议的股东所持表决权的三分之二以上通过。新闻背景中未提及具体表决权比例要求，但若合同金额巨大，对公司经营有重大影响，应视为特别决议事项，需满足上述表决权比例要求。

三、议案通过条件是否满足

1. 议案内容：新闻背景中提到的议案是关于公司及子公司拟签订重大经营合同，合同总金额预计不超过人民币40亿元。该议案内容明确，符合股东大会审议范围。

2. 通过条件：如前所述，若该议案被视为特别决议事项，则需经出席会议的股东所持表决权的三分之二以上通过。新闻背景中未提及具体表决结果，但判断表决程序是否合法，需关注最终表决结果是否满足通过条件。

四、信息披露义务是否履行

1. 信息披露内容：根据《证券法》及相关规定，上市公司发生可能对其股票交易价格产生较大影响的重大事件，投资者尚未得知时，应当立即披露，说明事件的起因、目前的状态和可能产生的法律后果。新闻背景中，有方科技已披露拟签订重大经营合同的信息，符合信息披露要求。

2. 信息披露时间：信息披露应及时，确保投资者能够在合理时间内获取相关信息。新闻背景中未提及具体披露时间，但判断信息披露义务是否履行，需关注公司是否在合理时间内进行了披露。

热点事件延伸思考与法律建议

1. 对公司的法律建议：公司应确保股东大会召集程序、表决权行使、议案通过条件及信息披露义务均符合法律规定，以避免因程序瑕疵导致的法律风险。

2. 对投资者的启示：投资者应关注公司股东大会的召集程序、表决结果及信息披露情况，以评估公司决策的合法性和透明度，从而做出理性的投资决策。

3. 类似情况的预防措施：对于其他上市公司而言，应建立健全公司治理结构，完善股东大会召集、表决及信息披露等制度，确保公司决策的合法性和有效性。

综上所述，结合新闻背景及法律条文分析，有方科技拟签订40亿重大合同并召开股东大会进行审议的表决程序是否合法，需从股东大会召集程序、表决权行使、议案通过条件及信息披露义务四个方面综合判断。若公司均按法律规定履行了相关义务，则表决程序合法。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。