用工主体责任未生效的情况下，员工仍然可以申请工伤认定。以下从不同角度对此问题进行详细分析：

一、用工主体责任与工伤认定的独立性

用工主体责任主要关注的是用人单位在劳动关系中的义务和责任，而工伤认定则是基于员工在工作过程中是否受到事故伤害或患职业病，以及这种伤害或疾病是否符合《工伤保险条例》中“工伤”的定义。两者是相对独立的过程，用工主体责任是否生效，并不影响员工申请工伤认定的权利。

二、工伤认定的法定条件

根据《工伤保险条例》第十四条、十五条规定，以下情形应认定为工伤或视同工伤：

1. 在工作时间和工作场所内，因工作原因受到事故伤害的；
2. 工作时间前后在工作场所内，从事与工作有关的预备性或者收尾性工作受到事故伤害的；
3. 在工作时间和工作场所内，因履行工作职责受到暴力等意外伤害的；
4. 患职业病的；
5. 因工外出期间，由于工作原因受到伤害或者发生事故下落不明的；
6. 在上下班途中，受到非本人主要责任的交通事故或者城市轨道交通、客运轮渡、火车事故伤害的；
7. 在工作时间和工作岗位，突发疾病死亡或者在48小时之内经抢救无效死亡的；
8. 在抢险救灾等维护国家利益、公共利益活动中受到伤害的；
9. 原在军队服役，因战、因公负伤致残，已取得革命伤残军人证，到用人单位后旧伤复发的。

只要员工的受伤情形符合上述条件之一，就具备申请工伤认定的资格，与用工主体责任是否生效无关。

三、用工主体责任未生效时的工伤认定意义

虽然用工主体责任未生效可能意味着员工不能从工伤保险基金获得相关待遇，但进行工伤认定仍然具有重要意义。一旦被认定为工伤，员工可以要求用人单位按照《工伤保险条例》规定的工伤保险待遇项目和标准支付费用，这包括但不限于医疗费用、康复费用、停工留薪期间的工资福利等。

四、建议与注意事项

1. 及时申请工伤认定：员工在受伤后，应尽快向当地社会保险行政部门提出工伤认定申请，以确保自己的权益得到及时保障。
2. 保留相关证据：员工在申请工伤认定时，应提供与工作相关的证据，如工作证、考勤记录、医疗证明等，以证明自己的受伤情形符合工伤认定的条件。
3. 关注用工主体责任：虽然用工主体责任未生效不影响工伤认定的申请，但员工仍应关注用人单位是否履行了用工主体责任，如是否按时支付工资、是否提供安全的工作环境等。如果用人单位未履行相关责任，员工可以通过法律途径维护自己的权益。

综上所述，用工主体责任未生效并不影响员工申请工伤认定。员工只要符合《工伤保险条例》中规定的工伤条件，即有权申请工伤认定，并要求用人单位按照相关规定支付工伤保险待遇。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。