国企员工在被公安机关调查期间辞职，其后果主要取决于调查的性质、结果以及辞职的具体情况，以下分情况讨论：
若调查与员工个人行为无关，或员工未被认定有违法行为：
- 辞职流程与后果：在此情况下，员工辞职通常不会受到调查的直接影响。员工可以按照国企的正常辞职流程，提前向单位提出书面辞职申请，并按照单位规定办理离职手续。辞职后，员工与国企的劳动关系即行终止，员工可以自由选择新的工作单位或职业。
- 法律建议：尽管调查可能未涉及员工个人，但员工在辞职前仍应仔细阅读劳动合同和单位规章制度，确保自己的辞职行为符合相关规定，避免因违反合同或规定而承担不必要的法律责任。
若调查涉及员工个人行为，且员工被认定有违法行为但尚未构成犯罪：
- 辞职流程与后果：在此情况下，员工可能面临单位的纪律处分，如警告、记过、降级、撤职等。若员工选择辞职，单位可能会根据其违法行为的性质和严重程度，决定是否同意其辞职申请。若单位同意，员工需按照单位规定办理离职手续；若单位不同意，员工可能需继续接受单位的纪律处分或等待调查结果。
- 法律建议：员工在面临此类情况时，应积极配合调查，如实陈述事实，争取从轻或减轻处分。同时，员工在辞职前应与单位充分沟通，了解单位的态度和决定，以便做出合理的职业规划。
若调查涉及员工个人行为，且员工被认定有犯罪行为：
- 辞职流程与后果：在此情况下，员工可能面临刑事责任的追究，如被刑事拘留、逮捕、起诉等。一旦员工被采取刑事强制措施，其辞职申请通常会被单位暂停处理，直至刑事案件审结。若员工被判处有期徒刑以上刑罚，其与国企的劳动关系将自动解除；若员工被判处缓刑或免予刑事处罚，单位可能会根据其犯罪行为的性质和严重程度，决定是否与其解除劳动关系。
- 法律建议：员工在面临此类情况时，应立即寻求专业律师的帮助，了解自己的法律权利和义务，积极配合司法机关的调查和审判工作。同时，员工应做好职业规划，考虑未来可能面临的就业困难和职业限制。
额外提醒：
- 国企员工在被公安机关调查期间，应保持冷静和理智，不要盲目辞职或采取其他过激行为。
- 员工应仔细阅读劳动合同和单位规章制度，了解自己的权利和义务，以便在辞职或面临纪律处分时做出合理的决策。
- 若员工对单位的决定或处理结果有异议，可以通过合法途径维护自己的权益，如申请劳动仲裁或提起诉讼等。
总结来说，国企员工在被公安机关调查期间辞职的后果因调查性质、结果和辞职情况而异。员工在面临此类情况时，应积极配合调查、了解自己的法律权利和义务，并根据实际情况做出合理的职业规划。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。