结论：夫妻店中一方长期阻碍经营，能否立案需视具体情况而定，但通常可以通过法律途径解决，包括提起民事诉讼或申请行为保全等。
一、法律途径的可行性
在夫妻共同经营的店铺中，若一方长期阻碍经营，这可能构成对另一方合法权益的侵害。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，夫妻双方在婚姻关系存续期间所得的财产，归夫妻共同所有，双方有平等的处理权。因此，一方无权单方面阻碍另一方的正常经营活动。
二、具体法律措施
提起民事诉讼：
- 诉讼请求：受损方可以向人民法院提起民事诉讼，要求对方停止侵害、排除妨碍、恢复原状或赔偿损失等。
- 法律依据：依据《民法典》中关于夫妻共同财产和侵权责任的相关规定，受损方有权要求对方承担相应的法律责任。
- 诉讼流程：受损方需准备相关证据，如经营记录、财务记录、阻碍经营的证据等，以证明对方的侵权行为和自己的损失。然后，向有管辖权的人民法院提起诉讼，并按照法院的指引进行后续诉讼流程。
申请行为保全：
- 申请条件：在诉讼过程中，如果受损方认为对方的阻碍行为可能对其造成难以弥补的损害，可以向人民法院申请行为保全，要求对方立即停止阻碍行为。
- 法律依据：依据《中华人民共和国民事诉讼法》中关于行为保全的相关规定，受损方有权在紧急情况下申请行为保全以保护自己的合法权益。
- 申请流程：受损方需向人民法院提交行为保全申请书，并提供相关证据证明对方的阻碍行为和可能造成的损害。法院在审查后，如果认为符合申请条件，将裁定采取行为保全措施。
三、实际操作中的注意事项
- 证据收集：在提起诉讼或申请行为保全前，受损方应尽可能收集相关证据，以证明对方的阻碍行为和自己的损失。这些证据可以包括经营记录、财务记录、证人证言、视频监控等。
- 法律咨询：由于法律程序复杂且涉及专业法律知识，受损方在采取法律措施前，建议咨询专业律师以获取更具体的法律建议和指导。
- 和解与调解：在诉讼过程中或诉讼前，双方也可以尝试通过和解或调解的方式解决纠纷。这不仅可以节省时间和成本，还可以维护双方的关系和店铺的正常经营。
四、可能的法律后果
如果受损方成功提起诉讼并获得法院支持，对方可能需要承担停止侵害、排除妨碍、恢复原状或赔偿损失等法律责任。如果对方拒不履行法院判决或裁定，还可能面临强制执行等法律后果。
建议：在夫妻店中遇到一方长期阻碍经营的情况时，受损方应首先尝试与对方沟通协商解决问题。如果协商无果，可以寻求专业律师的帮助，通过法律途径维护自己的合法权益。如有具体法律问题，可以直接向我咨询。