针对您提出的“货车运输烟叶被扣车了会对车主怎么处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
货车在运输烟叶过程中若被查处，其法律后果主要取决于是否有合法运输手续以及烟叶的数量等因素。以下是对此问题的综合解读与分析：
一、合法与非法运输的界定
合法运输：
- 若货车持有合法的运输许可证等相关手续，并在规定范围内进行运输，则该行为被视为合法，通常不会受到处罚。
非法运输：
- 若未取得合法运输手续或超出准运证规定数量进行运输，则被视为违法行为，并将依据相关法律法规进行处理。
二、非法运输的法律后果
（一）行政处罚
罚款：
- 根据《中华人民共和国烟草专卖法》及其实施条例，无准运证或超过准运证规定数量托运、自运烟草专卖品的，由烟草专卖行政主管部门处以罚款。罚款金额通常基于查获地省级烟草专卖行政主管部门出具的上年度烟叶平均收购价格的70%来计算。
违法烟草制品的收购与没收：
- 烟草专卖行政主管部门可按上述价格标准收购违法运输的烟叶，以降低违法者的经济收益。
- 对于情节严重的违法行为，烟草专卖行政主管部门有权没收违法运输的烟草专卖品及违法所得。
对承运人的处罚：
- 若承运人明知是烟草专卖品而为无准运证的单位或个人运输，同样将面临没收违法所得及罚款的处罚。
（二）刑事处罚
- 非法经营罪：
- 若非法运输的烟叶数量较大，情节严重，可能构成非法经营罪。根据《刑法》及相关司法解释，未经烟草专卖行政主管部门许可，非法经营烟草专卖品且情节严重的，将以非法经营罪定罪处罚。
- 具体量刑标准包括：处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处违法所得一倍以上五倍以下罚金；情节特别严重的，处五年以上有期徒刑，并处违法所得一倍以上五倍以下罚金或者没收财产。
三、实际案例参考
行政处罚案例：
- 某货车无合法手续运输烟叶100斤，若当地省级烟草专卖行政主管部门出具的上年度烟叶平均收购价格为每斤20元，则烟草专卖行政主管部门可能会对当事人处以罚款，并以14元/斤的价格收购这100斤违法运输的烟叶。
刑事处罚案例：
- 若货车运输的无合法手续烟叶价值达到8万元，就可能构成非法经营罪。法院可能根据具体情况判处犯罪嫌疑人有期徒刑（如2年），并处罚金（如4万元）。
四、总结与建议
货车运输烟叶被扣车后，车主可能面临的法律后果包括罚款、违法烟草制品的收购与没收，甚至可能面临刑事处罚。因此，我建议您在运输烟叶前，务必确保已取得合法的准运证，并严格遵守相关的运输规定，以避免不必要的法律风险和经济损失。同时，也建议您关注烟草专卖行政主管部门的监管动态，确保自身经营活动的合法性。