在司法实践中，若一方提出鉴定申请而对方拒绝配合，可按以下步骤处理：

1. 明确鉴定必要性及法律依据
   首先需确认鉴定事项是否属于法定必须鉴定的范围（如伤残等级、文书真伪、工程质量等），且鉴定结果对案件事实认定具有关键作用。根据《民事诉讼法》第76条，当事人可就查明事实的专门性问题向法院申请鉴定，法院认为必要的应委托鉴定。若鉴定申请符合程序要求且与案件关联性紧密，对方无正当理由拒绝配合可能构成妨碍诉讼行为。

2. 分情况处理对方拒绝配合的情形

   • 情况一：对方无正当理由拒绝配合
     若对方未提出合理抗辩（如鉴定机构资质存疑、鉴定事项超出范围等），法院可依据《民事诉讼法》第114条，对其采取训诫、罚款、拘留等强制措施，或直接根据已有证据认定事实（如推定申请方主张成立）。例如，在人身损害案件中，被告拒绝配合伤残等级鉴定，法院可能直接采纳原告提交的医疗证明认定伤残等级。
     
   • 情况二：对方提出合理抗辩
     若对方对鉴定程序提出实质性异议（如鉴定机构选择、鉴定方法科学性等），法院需审查异议是否成立。若异议成立，可重新指定鉴定机构或调整鉴定方案；若异议不成立，应书面责令对方配合，逾期仍拒绝的，按情况一处理。
     
   • 情况三：鉴定事项本身存在程序瑕疵
     若鉴定申请未在举证期限内提出，或鉴定事项与案件无关，法院可能直接驳回申请，此时无需强制对方配合。

3. 实务建议

   • 申请方：提交鉴定申请时，需同步提供鉴定必要性说明（如案件争议焦点、鉴定与事实的关联性）及鉴定机构资质证明，提高法院准许概率。
     
   • 被申请方：若对鉴定有异议，应在收到法院通知后3日内书面提出，并附具体理由及证据（如鉴定机构无资质、鉴定方法不科学等），避免被认定为“无正当理由拒绝”。
     
   • 法院角色：法院需严格审查鉴定申请的合法性、必要性及鉴定机构的资质，避免因程序瑕疵导致鉴定结果不被采信。

若您遇到具体案件中对方拒绝配合鉴定的情况，可进一步向我说明案件类型（如民事侵权、合同纠纷、婚姻家事等）及争议焦点，我将结合实务经验为您分析应对策略。