没有经营主体的公司，严格意义上来说，是不能进行合作的。以下从几个方面进行详细分析：
一、法律层面的分析
合作的基础：合作通常建立在双方或多方具有法律主体资格的基础上。没有经营主体的“公司”，实际上可能并不具备法律上的独立人格，因此无法作为合作的合法一方。根据《中华人民共和国公司法》的相关规定，公司必须依法设立，并具备独立的法人资格，才能以自己的名义从事民事活动，包括与其他主体进行合作。
合同效力：如果尝试与没有经营主体的“公司”签订合作合同，该合同可能因主体不适格而被认定为无效或可撤销。这将对合作双方的权益造成严重损害，因为无效或可撤销的合同无法产生预期的法律效果，双方可能无法依据合同主张权利或履行义务。
二、实际操作层面的分析
信誉与风险：没有经营主体的“公司”往往缺乏稳定的经营基础和良好的信誉记录。与这样的“公司”合作，可能会面临较高的风险，如对方无法履行合作义务、卷款跑路等。这些风险将直接影响合作的顺利进行和双方的利益。
合作流程与规范：正常的合作流程包括签订合作合同、明确双方权利义务、设立合作账户、进行资金往来等。然而，没有经营主体的“公司”可能无法完成这些流程，或者无法按照规范进行操作。这将导致合作过程混乱不堪，难以达到预期的合作效果。
三、建议与措施
核实对方身份：在与任何“公司”进行合作前，务必核实其是否具备合法的经营主体资格。可以通过查询工商登记信息、了解对方经营状况等方式进行核实。
签订正规合同：如果对方确实具备合法的经营主体资格，那么在合作前应签订正规的合作合同，明确双方的权利义务、合作期限、违约责任等条款。这有助于保障双方的权益，减少合作过程中的纠纷。
寻求法律帮助：如果在合作过程中遇到任何法律问题或纠纷，应及时寻求专业律师的帮助。律师可以提供专业的法律意见和解决方案，帮助你维护自己的合法权益。
综上所述，没有经营主体的“公司”是不能进行合作的。为了保障自己的权益和降低合作风险，建议你在选择合作对象时务必谨慎核实对方的身份和经营状况。如果你有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。