三期人员被恶意处罚，通常是违法的。以下从不同角度为你详细分析：
一、法律对三期人员的特殊保护
“三期”指的是女职工的孕期、产期和哺乳期。我国法律对处于“三期”的女职工给予了特殊的保护，旨在保障她们的合法权益和身心健康。例如，《中华人民共和国劳动法》《中华人民共和国劳动合同法》以及《女职工劳动保护特别规定》等法律法规，都明确规定了用人单位不得因女职工怀孕、生育、哺乳而降低其工资、予以辞退、与其解除劳动或者聘用合同等。恶意处罚三期人员，很可能违反了这些法律法规中关于保护三期女职工权益的规定。
二、恶意处罚的具体情形及违法性分析
经济处罚：如果用人单位以三期女职工违反公司规定等为由，对其进行罚款等经济处罚，这种做法通常是违法的。因为法律法规并未赋予用人单位对员工进行罚款的权力（除特定行业如银行、证券等有特殊规定外），且对三期女职工进行经济处罚，很可能侵犯了她们的劳动报酬权。
纪律处分：若用人单位以三期女职工存在违纪行为等为由，给予警告、记过、降职等纪律处分，这种做法是否违法需视具体情况而定。如果三期女职工确实存在违纪行为，且用人单位的处分决定符合公司规章制度以及法律法规的规定，那么这种处分可能是合法的。但如果用人单位在处分过程中存在歧视、不公正对待三期女职工的情况，或者处分决定缺乏事实依据和法律依据，那么这种处分就是违法的。
解除劳动合同：用人单位在三期女职工无过错的情况下，以恶意处罚为手段，试图解除与她们的劳动合同，这种做法是严重违法的。根据法律法规的规定，用人单位不得因女职工怀孕、生育、哺乳而与其解除劳动合同，除非女职工存在严重违反公司规章制度、严重失职、营私舞弊等法定解除情形。
三、三期人员遭遇恶意处罚的应对措施
与用人单位协商：三期女职工在遭遇恶意处罚时，可以首先尝试与用人单位进行协商，表达自己的诉求和意见，寻求合理的解决方案。
向劳动监察部门投诉：如果协商无果，三期女职工可以向当地的劳动监察部门投诉，请求劳动监察部门对用人单位的违法行为进行调查和处理。
申请劳动仲裁或提起诉讼：如果劳动监察部门的处理结果未能满足三期女职工的诉求，她们还可以向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁，或者向人民法院提起诉讼，通过法律途径维护自己的合法权益。
建议：如果你或你身边的人正处于三期且遭遇了恶意处罚，不要慌张，及时收集相关证据，如工资条、处罚决定书、工作记录等，以便在后续的协商、投诉、仲裁或诉讼过程中证明自己的权益受到了侵害。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。