股权转让纠纷是公司治理中常见且复杂的一类问题，它涵盖了多个方面，包括但不限于合同效力、合同履行、程序性以及特殊情形下的纠纷。以下是对股权转让纠纷案由的详细归纳和解析：
一、股权转让合同效力纠纷
未办理批准手续的合同效力：
- 涉及国有股权或外资股权的转让，若未经相关政府部门审批，可能引发合同效力争议。例如，中外合资企业股权转让需经商务部门审批，未获批则合同可能被认定无效。
恶意串通损害他人利益的合同：
- 若转让方与受让方恶意串通，以明显不合理的低价转让股权，损害其他股东或债权人利益，该合同可能被撤销。
无权处分或越权代理引发的纠纷：
- 转让人非股权实际权利人（如隐名股东显名化前）或超越代理权限签订转让合同，可能导致合同无效或被撤销。
阴阳合同的效力问题：
- 为逃避税费或其他目的签订两份内容不同的合同，实际履行的“阴合同”效力可能因违反法律强制性规定而被否定。
瑕疵出资股东的股权转让：
- 出资存在瑕疵的股东转让股权时，受让人可能主张合同无效或要求转让方补足出资。
名义股东擅自转让股权：
- 名义股东未经实际出资人同意转让代持股权，可能引发权属争议及合同效力纠纷。
侵害优先购买权的合同：
- 未履行通知义务或变相排除其他股东优先购买权的转让行为，可能被其他股东主张无效。
公司章程限制条款的适用：
- 公司章程对股权转让设置特殊条件（如禁止向外部转让），违反此类规定的转让合同可能被认定无效。
二、股权转让合同履行纠纷
价款支付争议：
- 受让方未按约定时间或方式支付转让款，或转让方主张对方逾期付款构成违约。
标的股权交付问题：
- 转让方未及时配合办理工商变更登记或股东名册更新，导致受让方无法行使股东权利。
公司资产状况隐瞒：
- 转让方未如实披露目标公司的债务、担保等风险信息，受让方发现后要求解除合同或索赔。
过渡期损益归属争议：
- 股权转让协议签署日至交割日期间的公司盈亏分配不明确，双方就责任承担产生分歧。
报批义务履行纠纷：
- 需行政审批的股权转让中，转让方拖延或不配合提交申请文件，导致交易受阻。
三、股权转让程序性纠纷
股东会决议瑕疵：
- 其他股东以股东会召集程序违法为由，主张转让决议无效。
优先购买权侵权诉讼：
- 被侵害优先购买权的股东通过诉讼确认转让行为无效，并要求赔偿损失。
工商变更登记障碍：
- 因材料不全或政策限制等原因，登记机关拒绝办理股权过户手续。
隐名股东显名化争议：
- 实际出资人请求确认股东资格并办理变更登记时，名义股东或公司其他股东提出异议。
四、特殊情形下的股权转让纠纷
离婚财产分割中的股权处置：
- 夫妻共有股权在离婚时的价值评估、分割方式及执行难题。
继承引发的股权变动纠纷：
- 多个继承人就股权继承份额、行使方式产生争议，或公司章程对继承设置限制条件。
股权回购请求权纠纷：
- 特定情形下（如异议股东回购、对赌协议触发），公司或原股东拒绝履行回购义务。
冒名转让股权的法律后果：
- 行为人伪造签名转让他人股权，被冒名者主张恢复股东身份并追究侵权责任。
在处理股权转让纠纷时，应充分考虑不同纠纷类型的法律适用和举证责任差异，确保根据具体的案件事实和法律规定来确定准确的案由，并采取有效的法律措施来维护自身权益。希望这些信息能对您有所帮助。如果您有任何进一步的问题或需要更详细的解答，请随时告诉我。