在经营权转让的过程中，确实可能会遇到多种类型的法律纠纷，这些纠纷构成了经营权转让的主要案由。以下是对这些案由的详细归纳和解释：

一、合同纠纷类

1. 确认合同效力纠纷

   • 描述：当经营权转让合同存在影响效力的因素，如合同一方无民事行为能力、合同内容违法、存在欺诈或胁迫等情形时，可能引发此类纠纷。
   • 实例：若转让方未经合法授权或未经必要程序（如股东会同意）擅自转让经营权，可能导致合同无效或可撤销。

2. 合同履行纠纷

   • 描述：合同签订后，若一方未按照约定履行其义务，如未支付转让款、未协助办理变更手续等，将产生合同履行纠纷。
   • 实例：转让方未按约定协助受让方办理相关证照变更，影响受让方的正常经营。

3. 合同解除纠纷

   • 描述：当合同中出现解除事由，如一方严重违约、不可抗力等，一方主张解除合同而另一方不同意，或解除合同后的相关事宜（如赔偿、清算等）存在争议时，将引发合同解除纠纷。
   • 实例：受让方经营业绩不达标，转让方要求解除合同，但受让方不同意并主张继续履行。

4. 特定领域合同纠纷

   • 农村土地承包经营权：涉及权属争议、承包合同纠纷、流转纠纷等。
   • 商业特许经营权：包括合同纠纷、侵权行为等，如特许人违反合同约定或侵犯受许人权益。
   • 公司、店铺经营权：涉及转让合同纠纷、租赁纠纷等，如经营权转让与租赁合同的交叉问题。

二、侵权纠纷类

1. 侵害经营权纠纷

   • 描述：未经合法授权或违反合同约定，擅自干涉、阻碍另一方行使经营权的行为构成侵害经营权纠纷。
   • 实例：转让方在转让经营权后，仍擅自干扰受让方的正常经营。

2. 商业秘密侵权纠纷

   • 描述：在经营权转让过程中，若一方泄露或不当使用另一方的商业秘密，将构成商业秘密侵权纠纷。
   • 实例：受让方泄露转让方披露的独特配方或客户信息给第三方。

三、与行政相关的纠纷类

• 行政许可变更纠纷
  • 描述：经营权转让往往需要办理相关的行政许可变更手续。若行政机关拒绝办理或存在违法行为，将引发行政许可变更纠纷。
  • 实例：交通运输管理部门拒绝办理出租车公司经营许可的变更手续，导致转让无法完成。

四、纠纷处理方式

在处理经营权转让纠纷时，双方当事人可以首先尝试通过协商达成和解。若协商无果，可以请求第三方（如村民委员会、乡（镇）人民政府等）进行调解。若调解仍无法解决问题，双方可以根据合同中的仲裁条款或事后达成的仲裁协议，向相关仲裁机构申请仲裁。最后，若仲裁也无法解决纠纷，双方可以向人民法院提起诉讼。

综上所述，经营权转让过程中的法律纠纷复杂多样，涉及合同、侵权、行政等多个法律领域。在处理这些纠纷时，应明确纠纷性质，选择适当的处理方式，并寻求专业法律人士的帮助以确保自身权益得到妥善维护。