存疑不诉的情况下，能否要回赔偿金需视具体情况而定，以下分情况讨论：
存疑不诉是刑事诉讼中的概念，指检察机关对案件证据不足、无法形成完整证据链时，依法作出的不起诉决定。这一决定仅针对刑事责任，不涉及民事赔偿问题。根据《刑事诉讼法》及相关司法解释，存疑不诉并不等同于无罪，而是因证据不足无法认定犯罪事实。因此，存疑不诉本身不直接决定民事赔偿的能否主张。若民事赔偿请求基于独立的事实和法律依据（如合同违约、侵权行为等），即使刑事程序因存疑不诉终止，民事赔偿请求仍可单独通过民事诉讼程序主张。
刑事与民事赔偿的关联性分析
若民事赔偿与刑事犯罪直接相关（如因犯罪行为导致的财产损失），存疑不诉可能影响民事赔偿的证明标准。在民事诉讼中，赔偿请求人需承担举证责任，证明侵权行为、损害结果及因果关系。若刑事程序中因证据不足未认定犯罪，民事诉讼中可能面临同样的举证困难。但需注意，民事诉讼的证明标准（高度盖然性）低于刑事诉讼（排除合理怀疑），因此即使刑事存疑不诉，民事诉讼中仍可能因证据充分而获得赔偿。
若民事赔偿与刑事犯罪无关（如合同纠纷中的违约赔偿），存疑不诉对民事赔偿无直接影响。此时，赔偿请求人可直接依据合同约定或法律规定，通过民事诉讼主张权利，无需依赖刑事程序的认定结果。
实务操作建议
证据收集与固定：无论刑事程序结果如何，民事赔偿请求人均应积极收集、固定证据（如合同、转账记录、损失证明等），以支持其主张。
分案处理：若刑事与民事赔偿请求基于不同事实，建议分别通过刑事程序（如申诉）和民事程序主张权利，避免混淆法律关系。
法律程序衔接：在刑事程序存疑不诉后，若民事赔偿请求需依赖刑事程序中的证据（如鉴定意见、证人证言等），应及时申请法院调取或要求相关主体出具书面证明，以确保民事诉讼中的证据充分性。
总结：存疑不诉不直接决定民事赔偿的能否主张，关键在于民事赔偿请求是否具备独立的事实和法律依据。若民事赔偿与刑事犯罪无关，可直接通过民事诉讼主张；若相关，则需根据民事诉讼的证明标准，结合证据情况综合判断。如有具体案件或证据问题，建议直接向我咨询，以便进一步分析。