在刑事立案案件中发现的行政案件，一般不需要单独立案，但需根据具体情况进行区分处理。以下是具体分析：

1. 案件性质决定处理方式
   刑事案件与行政案件的管辖主体、程序和法律后果存在本质差异。若刑事立案中发现的违法行为同时违反行政法规（如治安管理处罚法），但尚未达到刑事追诉标准，公安机关通常会在刑事程序中一并处理行政违法部分，无需单独立案。例如，盗窃未达刑事立案标准但违反治安管理的，可直接给予行政处罚。

2. 需单独立案的特殊情形
   若行政违法行为与刑事犯罪无直接关联，或需由其他行政机关管辖（如环保、税务等），则需移送相关部门并可能涉及单独立案。例如：

   • 刑事案件中发现的非法排污行为，需由生态环境部门立案调查；
     
   • 刑事案件中发现的税务逃漏行为，需由税务机关启动行政程序。
     此时，刑事与行政案件分属不同法律关系，需分别处理。

3. 程序衔接的注意事项
   根据《公安机关办理刑事案件程序规定》，公安机关在侦查中发现不应追究刑事责任但需行政处理的，应依法撤销案件并移送有关机关。实践中，需注意：

   • 证据转化：刑事侦查中收集的证据，经合法性审查后可用于行政案件；
     
   • 效率原则：避免重复调查，减少当事人诉累。

建议：若您遇到具体案件中刑事与行政程序交叉的问题，可提供更多细节（如案件类型、行为性质等），我将进一步分析法律适用及程序选择。