结论前置：在对方车主没有保险的情况下，合作医疗能否报销需分情况讨论。

1. 交通事故责任认定与医保报销的关系
   根据《社会保险法》第三十条，若交通事故责任在对方（即对方全责或主责），则医疗费用应由侵权方（对方车主）承担，医保基金不予支付。此时需通过交警部门出具的《交通事故责任认定书》明确责任划分，若对方无保险且拒不赔偿，您可通过民事诉讼主张赔偿（包括医疗费、误工费等）。

2. 合作医疗的报销限制
   合作医疗（城乡居民基本医疗保险）的报销范围通常排除“第三方责任”导致的医疗支出。若您在事故中无责任（如对方全责），即使对方无保险，合作医疗原则上也不报销，但存在例外情形：

• 对方逃逸或无力赔偿：部分地区医保政策允许在无法从第三方获得赔偿时，由医保基金先行支付（需提供交警证明、法院判决等材料），后续医保部门可向第三方追偿。
  
• 您承担部分责任：若事故责任部分在您（如次责），则您自负部分的医疗费可能符合合作医疗报销条件，但需扣除应由对方承担的部分。

1. 实务建议
   

• 立即报警并固定证据：要求交警出具《交通事故责任认定书》，明确对方责任。
  
• 协商或诉讼追偿：若对方无保险且拒赔，可向法院起诉要求赔偿，同时申请财产保全（如查封对方车辆、房产等）。
  
• 咨询当地医保部门：部分地区对“第三方责任”的报销政策有细化规定（如报销比例、材料要求），需以当地政策为准。
  

提示：交通事故赔偿与医保报销存在法律竞合，建议优先通过侵权诉讼主张赔偿，避免因医保报销影响后续索赔权益。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体操作流程。