事业单位工作人员在企业持有股份是否违规，需视具体情况而定，但核心原则是不得违反国家法律法规及单位内部规定，且不存在利益冲突。以下是对此问题的详细分析：
一、法律法规层面
一般限制：
- 根据《事业单位工作人员处分暂行规定》第十八条，事业单位工作人员不得违反国家规定从事、参与营利性活动或兼任职务领取报酬。这意味着，如果事业单位工作人员未经允许在企业持有股份并获取收益，可能面临警告、记过、降低岗位等级、撤职乃至开除等处分。
特殊允许情况：
- 部分地区或特定事业单位为鼓励创新创业，可能允许在满足一定条件（如审批、报备程序）下，科研人员等利用科技成果转化进行兼职取酬或持股。但这种情况属于例外，且需严格遵守相关规定。
二、具体情形分析
无利益关联情况：
- 如果事业单位工作人员持有的企业股份与其所在单位的业务无直接或潜在利益关系，且已按照单位要求进行了申报和审批，那么这种持股行为通常是合规的。例如，某事业单位的员工持有与其工作无关的外地企业股权，并履行了相关报备手续，此情况通常不会构成违规。
存在利益关联情况：
- 如果事业单位工作人员持有的企业股份与其所在单位有直接或潜在的利益关系，如物资采购、项目合作等，那么这种持股行为可能构成利益冲突，违反相关规定。因为这种情况下，工作人员可能难以保持公正立场，从而损害单位及公共利益。
三、持股的风险与责任
利益冲突风险：
- 持股可能导致事业单位工作人员在工作中难以保持公正立场，影响工作评价及职业声誉。例如，在涉及持股企业的项目决策中，工作人员可能因个人利益而做出不利于单位的决策。
法律责任风险：
- 如果持股的企业经营过程中发生违法违规行为或经济亏损，作为股东的事业单位工作人员可能需要承担相应的法律责任和经济损失。这包括但不限于民事赔偿、行政处罚甚至刑事责任。
四、建议与指导
事先咨询：
- 在考虑持股前，事业单位工作人员应详细了解本单位的具体规定和国家相关政策。必要时，可以向单位人事部门、纪检部门或当地人社部门咨询，以确保行为合法合规。
风险评估：
- 充分评估持股可能带来的各种风险和责任，包括利益冲突风险、法律责任风险等。做好充分的准备和规划，避免未来陷入不必要的法律纠纷或经济损失。
合规操作：
- 如果决定持股，应确保所有操作都符合法律法规和单位规定。这包括但不限于申报审批程序、利益冲突回避等。
举例说明：假设某事业单位的工作人员小张，其家族经营了一家与事业单位业务无关的餐饮企业。小张在考虑持有该企业股份前，先向单位人事部门咨询了相关规定，并履行了报备手续。由于该企业与小张所在单位无直接利益关系，且小张的操作符合规定，因此这种持股行为是合规的。
综上所述，事业单位工作人员在企业持有股份是否违规，需根据具体情况判断。如果有任何疑虑或不确定因素，可以直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见。