结论前置：关于“旷工3天自动离职扣几天工资”的问题，用人单位不能随意克扣劳动者整月工资，工资扣除应基于实际旷工天数及用人单位依法制定并公示的规章制度，且扣除部分需合理，不得使劳动者实际所得低于当地最低工资标准。
详细分析：
旷工与工资扣除的基本原则：
- 旷工当天工资：根据劳动法规定，旷工当天用人单位可以不支付工资，因为劳动者未提供劳动。但旷工一天扣多日工资的做法是违法的。
- 工资扣除限制：若劳动者旷工，用人单位可以扣除相应天数的工资，但需确保扣除后的工资不低于当地最低工资标准。例如，若劳动者日工资为200元，旷工3天，则用人单位最多可扣除600元，且扣除后工资不得低于当地最低工资标准。
自动离职的法律定义与工资处理：
- 法律定义：“自动离职”并非法律术语。若用人单位规章制度中明确规定旷工三天为严重违反规章制度，用人单位可以解除劳动合同。但解除劳动合同时，用人单位必须一次性支付劳动者应得的工资，不得因旷工而拒绝支付已工作天数的工资。
- 工资结算义务：根据《工资支付暂行规定》第九条，劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。
用人单位规章制度的合法性：
- 制定程序需合法：用人单位规章制度应经过民主程序制定，如职工代表大会讨论通过，并向劳动者公示或告知，确保员工知晓并同意相关内容。
- 内容需合理：规章制度内容应合理，不得违反法律法规的强制性规定。例如，规定旷工三天扣整月工资的做法显然不合理，也不合法。
经济损失赔偿的特殊情况：
- 若劳动者旷工给用人单位造成经济损失，用人单位可以要求赔偿，但赔偿的扣除需遵循法律规定。根据《工资支付暂行规定》第十六条，每月扣除部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣除后工资不得低于当地最低工资标准。
实际操作建议：
- 查看规章制度：劳动者在面临旷工及工资扣除问题时，应先查看用人单位的规章制度或咨询相关部门负责人，了解具体的扣工资规定。
- 协商与投诉：如对处理结果有异议，劳动者应及时与用人单位协商，协商不成时，可向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，以维护自己的合法权益。
举例说明：
假设小李在某公司工作，日工资为200元，因个人原因旷工3天。若公司规章制度规定旷工一天扣一天工资，且未给公司造成经济损失，则公司应扣除小李600元工资，并支付剩余工资。若公司规章制度规定旷工三天扣整月工资，则该规定违法，小李有权要求公司支付剩余工资，并可向劳动监察部门投诉。
综上所述，用人单位在处理员工旷工及工资扣除问题时，应严格遵守相关法律法规，确保规章制度的合法性，并在扣除员工工资时遵循法定限额。劳动者也应了解自己的权利与义务，依法维护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。