建筑工程施工合同纠纷案件在结算后，通常不直接适用专属管辖的规定，但存在例外情况。以下是对此问题的详细分析：
一、一般原则：不适用专属管辖
法律依据：
- 根据《中华人民共和国民事诉讼法》第三十四条（2021年修正后为第三十五条），因不动产纠纷提起的诉讼，由不动产所在地人民法院专属管辖。但此处的“不动产纠纷”主要指的是不动产物权纠纷，如物权设立、权属、变更、转让等引起的纠纷。
- 建设工程施工合同纠纷并不直接涉及不动产物权的确认或变动，而是基于施工合同的履行产生的债权债务关系。因此，从法律条文的角度来看，它并不直接适用专属管辖。
司法实践：
- 在司法实践中，最高人民法院也倾向于将建设工程施工合同纠纷按照一般合同纠纷来处理，即由被告住所地或合同履行地人民法院管辖。这是因为建设工程施工合同纠纷的本质是合同纠纷，而非不动产物权纠纷。
二、例外情况：可能适用专属管辖
特定司法解释：
- 尽管一般原则是不适用专属管辖，但《最高人民法院关于适用〈中华人民共和国民事诉讼法〉的解释》第二十八条第二款曾规定，建设工程施工合同纠纷按照不动产纠纷确定管辖。然而，这一规定在后续司法实践中被进一步细化，并未将建设工程施工合同纠纷完全等同于不动产物权纠纷进行专属管辖。
- 实际上，根据最高人民法院的裁判观点及司法实践，建设工程施工合同纠纷在特定情况下（如涉及不动产的特定权益或纠纷性质与不动产紧密相关）可能被视为与不动产有关的纠纷，从而适用专属管辖。但这种情况较为罕见，且需要具体案件具体分析。
协议管辖：
- 如果双方当事人在建设工程施工合同中明确约定了管辖法院，且该约定不违反级别管辖和专属管辖的规定，则应按照约定确定管辖法院。这种情况下，即使纠纷涉及不动产，也可能不适用专属管辖。
三、实际建议
审查合同条款：
- 在处理建筑工程施工合同纠纷时，首先应审查合同中是否有关管辖法院的约定。如果存在有效约定，则应按照约定确定管辖法院。
分析纠纷性质：
- 如果合同中没有约定管辖法院，则需要分析纠纷的性质。如果纠纷主要涉及合同履行、工程款支付等债权债务关系，则通常适用一般合同纠纷的管辖原则。如果纠纷涉及不动产的特定权益或与不动产紧密相关，则可能需要考虑是否适用专属管辖。
咨询专业律师：
- 由于建筑工程施工合同纠纷的管辖问题较为复杂，且涉及法律条文和司法实践的多个方面，因此建议在处理此类纠纷时咨询专业律师。律师可以根据具体案件情况提供准确的法律意见和管辖建议。
总结来说，建筑工程施工合同纠纷案件在结算后通常不直接适用专属管辖的规定，而是根据纠纷性质和合同条款等因素来确定管辖法院。在处理此类纠纷时，建议仔细审查合同条款、分析纠纷性质，并咨询专业律师以获取准确的法律意见。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。