刑事案件申请重新鉴定的费用承担问题，需依据具体情况和法律规定来判断，可能由侦查机关、申请人、人民法院等承担。以下是对不同情况下鉴定费用承担主体的详细阐述：

1. 侦查机关承担的情况：

   • 在侦查阶段，若侦查机关（如公安机关）为解决案件中某些专门性问题而指派或聘请有专门知识的人进行鉴定，且该鉴定意见最终被作为定案根据，那么鉴定费用由侦查机关承担。例如，公安机关对犯罪现场的血迹进行DNA鉴定以确定犯罪嫌疑人，该费用即由公安机关负责支付。

2. 申请人承担的情况：

   • 若犯罪嫌疑人、被害人或其法定代理人、近亲属、辩护人对侦查机关的鉴定意见有异议，并提出补充鉴定或重新鉴定的申请，且经审查其申请理由不成立（如没有证据证明原鉴定存在错误），则重新鉴定的费用应由提出申请的一方承担。例如，犯罪嫌疑人认为涉案物品价格鉴定过高而申请重新鉴定，若申请理由不充分，则重新鉴定的费用通常由该犯罪嫌疑人承担。
   • 特殊情形：若申请重新鉴定是基于合理的怀疑，且最终鉴定意见与原鉴定意见存在显著差异，影响了案件的公正处理，那么在某些情况下，法院可能会根据公平原则，考虑由其他相关方承担部分或全部费用。但这并非普遍原则，需根据具体案件情况判断。

3. 人民法院承担的情况：

   • 在审判阶段，若人民法院认为有必要进行重新鉴定以查明案情，如涉及复杂的伤情认定、精神状态鉴定等，且该鉴定是法院主动指定或认为必要的，那么重新鉴定的费用可能由人民法院负责承担。例如，法院对被告人是否存在精神障碍进行鉴定以判断其刑事责任能力，相关鉴定费用即由法院支付。
   • 费用分配：在某些复杂案件中，法院可能会根据案件的具体情况和公平原则，在当事人之间合理分配重新鉴定的费用。这通常发生在鉴定费用较高，且由一方承担可能显失公平的情况下。

4. 其他特殊情况：

   • 经济困难：对于经济困难的被告人来说，如果确实无力承担重新鉴定费用，可以向相关部门（如法律援助机构）申请帮助。在某些情况下，法院也可能会考虑减免被告人的鉴定费用，以确保其合法权益得到保障。
   • 初次鉴定存在问题：如果初次鉴定存在明显错误或不公正的情况，导致需要进行重新鉴定以纠正错误，那么二次鉴定的费用可能不由申请人承担。在这种情况下，法院会根据实际情况判断责任归属，并可能要求初次鉴定的机构或个人承担相应的费用。

总结与建议：

刑事案件中重新鉴定费用的承担问题需根据具体情况和法律规定来判断。当事人在面临此类问题时，应首先明确鉴定所处的阶段、目的以及申请鉴定的主体，从而确定费用的承担者。同时，建议当事人在申请重新鉴定前，充分评估申请理由的充分性和必要性，以避免不必要的费用支出。如有具体疑问或需要进一步法律帮助，可以直接向我咨询。