结论：民事案件被转为刑事案件后，若检察院决定不起诉，案件将不会进入刑事审判阶段，但可能涉及民事赔偿或行政处罚等其他法律后果。以下是具体分析：

1. 不起诉的类型及法律后果

• 法定不起诉：若案件不符合刑事立案条件（如证据不足、情节显著轻微等），检察院会直接作出不起诉决定。此时，案件彻底终止刑事程序，但民事赔偿部分仍可能通过民事诉讼解决。
• 酌定不起诉：若犯罪情节轻微，检察院可决定不起诉。此时，行为人可能面临行政处罚（如罚款、拘留），但无需承担刑事责任。民事赔偿仍需另行处理。
• 存疑不起诉：若证据不足，检察院会退回补充侦查或直接不起诉。此时，若后续发现新证据，案件可能重新启动刑事程序。

2. 民事赔偿的独立性

• 民事案件与刑事案件的转化，不影响民事赔偿的独立性。即使刑事程序终止，受害人仍可通过民事诉讼要求赔偿损失（如人身损害、财产损失等）。
• 法律依据：《民法典》第186条明确，因当事人一方的违约或侵权行为，损害对方人身权益、财产权益的，受损害方有权选择请求其承担违约责任或侵权责任。

3. 行政处罚的可能性

• 若行为违反行政法规（如治安管理处罚法），即使不构成犯罪，公安机关仍可能给予行政处罚（如警告、罚款、行政拘留等）。
• 示例：故意伤害未达轻伤标准的，可能被处以行政拘留；非法经营未达刑事立案标准的，可能被罚款或没收违法所得。

4. 后续救济途径

• 申诉或复议：若对不起诉决定不服，可向上一级检察院申诉（《刑事诉讼法》第180条）。
• 民事诉讼：直接向法院提起民事诉讼，要求赔偿损失。
• 行政复议或诉讼：若对行政处罚不服，可申请行政复议或提起行政诉讼。

5. 实务建议

• 保留证据：无论刑事程序如何，均需保留与案件相关的证据（如合同、转账记录、伤情鉴定等），以备民事诉讼或行政程序使用。
• 咨询专业律师：刑事与民事交叉案件涉及程序复杂，建议委托律师协助处理，避免程序瑕疵导致权益受损。

总结：民事转刑事后不起诉，并不意味着案件完全终结。需根据不起诉类型，关注民事赔偿、行政处罚等后续问题，并依法行使救济权利。如有具体案件，可进一步向我咨询细节。