建筑企业内部承包人能否起诉建设单位，需分情况讨论：
内部承包人与企业关系明确，且合同相对性原则适用时：
- 通常情况下，建筑企业内部承包人并不直接与建设单位签订合同，而是与企业签订内部承包协议。根据合同的相对性原则，内部承包人一般不能直接起诉建设单位。因为合同是双方之间的法律约束，只有合同当事人才有权基于合同关系提起诉讼。
- 例外情况：如果内部承包人能够证明其与建设单位之间存在直接的合同关系（例如，建设单位直接与内部承包人签订了分包合同或补充协议），或者建设单位明确同意内部承包人直接向其主张权利，那么内部承包人可能具备起诉建设单位的资格。但这种情况较为少见，需要具体证据支持。
内部承包人代表企业履行合同义务，且企业怠于行使权利时：
- 如果内部承包人是以企业的名义与建设单位进行业务往来，且企业怠于行使对建设单位的权利（如拖欠工程款等），内部承包人可能无法直接起诉建设单位。但在此情况下，内部承包人可以依据其与企业之间的内部承包协议，要求企业承担违约责任或赔偿损失。
- 特殊途径：在某些情况下，如果内部承包人能够证明其实际履行了合同义务，且企业未向建设单位主张权利导致其利益受损，内部承包人可能通过代位权诉讼等方式间接维护自身权益。但这需要复杂的法律程序和证据支持。
涉及第三方权益或法律特别规定时：
- 如果内部承包人的权益受到建设单位的直接侵害（如建设单位直接扣款、罚款等），且该行为与内部承包人和企业之间的合同无关，内部承包人可能依据相关法律规定（如侵权责任法等）直接起诉建设单位。但这种情况需要具体分析法律关系和证据。
- 法律特别规定：在某些特定领域或项目中，法律可能对内部承包人的权利保护作出特别规定。例如，在建设工程领域，如果建设单位违反法定程序或合同约定损害内部承包人利益，内部承包人可能依据相关法律法规提起诉讼。
法律建议：
- 对于建筑企业内部承包人而言，如果认为自身权益受到建设单位侵害，首先应审查自身与建设单位之间的法律关系及合同约定。
- 如果内部承包人与建设单位之间无直接合同关系，建议通过企业向建设单位主张权利，或依据内部承包协议要求企业承担相应责任。
- 在必要时，内部承包人可以咨询专业律师，通过法律途径维护自身合法权益。但需注意，起诉建设单位需具备充分的法律依据和证据支持。
可能法律后果：
- 如果内部承包人未经充分准备和证据支持就起诉建设单位，可能面临败诉风险，并承担相应的诉讼费用和法律责任。
- 即使内部承包人具备起诉资格并胜诉，也可能因执行问题而无法实际获得赔偿或权益保障。因此，在起诉前需充分评估法律风险和执行可能性。
有问题可以直接向我咨询，我会结合你的具体情况给出更详细的法律建议。